V okviru raziskovalnega programa "Vzporedni in porazdeljeni sistemi" smo v obdobju 1999-2003 dosegli naslednje pomembnejše rezultate: Predlagali smo novo povezovalno topologijo d-mrež, ki omogoča krajše razdalje med računalniki. Rezultati simulacij kažejo, da predlagana mreža sodi med najboljše poznane, tako s stališča zahtevnosti komunikacije kot tudi z vidika cene. S tega področja smo objavili 2 članka v mednarodnih revijah ter pridobili patent za gradnjo d-mrež. Sporočanje v mreži procesorjev je eden od ključnih dejavnikov, ki vpliva na učinkovitost vzporednega računalnika. Če je medsebojno komuniciranje optimalno, potem je lahko optimalen tudi celoten vzporedni algoritem. Raziskovali in predlagali smo nove postopke pri različnih načinih sporočanja eden-enemu, eden-vsem in vsi-vsem, v mrežnih in torusnih topologijah. Dobili smo nove teoretske rezultate, ki smo jih objavili v mednarodnih revijah (3 članki). Izvedli smo računalniški program za simulacije v biomedicini, s katerim lahko na vzporednih računalnikih simuliramo dogajanja modelirana s parcialnimi diferencialnimi enačbami. Kot primer smo izvedli simulacijo ohlajevanja srca med operacijo, pri čemer smo upoštevali temperaturo in pretok tekočin. S tem smo opisali hladilno raztopino, ki kroži okrog srca. Rezultate računalniških simulacij je treba sproti preverjati. Zato smo izdelali merilno napravo in postopek za meritev bioelektričnih signalov vključno z merjenjem temperature, električnih potencialov, majhnih sil, itd. S tega področja smo objavili 6 člankov v mednarodnih revijah in posebno številko revije "Computers in Biology and Medicine", katere sourednik je bil tudi vodja raziskovalnega programa. Pomen našega raziskovalnega dela na področju zagotavljanja varnosti in zanesljivosti v računalniških in informacijskih sistemih je v izpostavljanju pomena človeškega dejavnika in uvajanja kvantitativnih metod za njegovo modeliranje in obvladovanje. Opravljali smo tudi bolj teoretične raziskave na nivoju formalizacije varnostnih politik (4 članki). Naše delo smo predstavljali in preverjali poleg objav, tudi v širši strokovni javnosti na mednarodnih konferencah, ob prijavah mednarodnih projektov, predavanjih na tujih ustanovah in v mednarodnem sodelovanju.