Člani programske skupine so v obdobju 1999-2003 kot glavne rezultate raziskovalnega programa objavili več monografij, več deset izvirnih znanstvenih člankov in sodelovali na več deset mednarodnih in domačih simpozijih z referati, ki so obravnavali tematiko iz slovenske politične, socialne, kulturne in cerkvene zgodovine od srednjega veka do vključno 20. stoletja. S tem so pomembno obogatili dosedanje vedenje o različnih problemih slovenske zgodovine v navedenih obdobjih in te rezultate sproti predstavljali tako domači kot tudi tuji znanstveni javnosti. Novi dosežki so bili upoštevani tudi v več učbenikih za srednje in osnovne šole. Člani projektne skupine so imeli stalne stike z raziskovalci v ZDA, Nemčiji, Avstriji, Italiji, Hrvatski.