Dosežki raziskovalne skupine so pomembni in vrhunski tudi v svetovnem merilu. V zadnjih petih letih smo veliko doprinesli k razumevanju vloge lizosomskih cisteinskih proteaz ter njihovih inhibitorjev v procesu proteolize. Gre za pomembna odkritja tako na področju razumevanja odnosa med strukturo in funkcijo proteoliznih encimov kot za razumevanje fiziološke vloge proteaz ter regulacije procesa proteolize. Tako smo npr. v preteklem obdobju pojasnili, kako lahko lizosomske cisteinske proteaze sodelujejo pri apoptozi. Gre za pionirske raziskave na tem področju in od izida članka v letu 2001 je bilo delo citirano že več kot 150-krat, kar nedvomno kaže na relevantnost in konkurenčnost naših raziskav. Pomembno je tudi odkritje, da lahko inhibitorji, ki so veljali za specifične za kaspaze, inhibirajo tudi lizosomske cisteinske proteaze, kar odpira nove poti v okviru raziskav apoptoze. Poleg tega so pomembne raziskave proteinov, ki vsebujejo tiroglobulinsko verigo tipa-1, kot npr. invariantna veriga MHC molekul II razreda in ekvistatina, ki nakazujejo nov pogled na procese regulacije cisteinskih proteaz v različnih procesih kot antigensko procesiranje in prezentacija v primeru invariantne verige ali ekvistatina iz morske vetrnice A. equina v agronomiji pri zatiranju rastlinskih škodljivcev. Vsekakor so zelo pomembna tudi nova spoznanja o katepsinu C, tako z biokemijskega kot strukturnega in medicinskega stališča, ter raziskave na področju raka, ki so pokazale, da so katepsini dejansko primerni kot diagnostični markerji pri nekaterih oblikah raka. Tako smo v tem obdobju objavili več člankov v revijah z IF večje kot 10.0, kar spada v zgornjih 5 % revij na tem izredno kompetitivnem področju. Posledično so dela tudi visoko citirana, tako ima samo vodja programa preko 8000 citatov (v zadnjih 3 letih letno približno 500 novih citatov), vsi sodelavci programa pa približno 15000. Tudi dela, ki so izšla v zadnjem petletnem obdobju so že bila velikokrat citirana (samo dela vodje programa več kot 520 krat). Ravno zaradi takšnih rezultatov so sodelavci programa pogosto vabljeni za predavatelje na mednarodnih konferencah in tujih univerzah, sodelavci pa so organizirali številne mednarodne simpozije doma. Sodelavci programa imajo tudi pomembne funkcije v mednarodnih strokovnih združenjih, so člani uredniških odborov uglednih mednarodnih revij. Nenazadnje mednarodni ugled kot posledico kakovostnih raziskav dokazujejo tudi številne uspešne sodelave z vrhunskimi raziskovalci iz uglednih tujih institucij (glej prilogo).