Konformacijske spremembe proteinov, udeleženih v boleznih: -ugotovili smo, da stefin A tvori simetrične dimere preko izmenjave domen in asignirali in v sodelovanju določili strukturo dimera - določitev dinamike monomera in dimera stefina A kot prva primerjava dinamike monomernega in dimernega proteina preko izmenjave domen, odkritje vpliva na dinamiko preko daljše razdalje - odkritje in karakterizacija tvorbe kompleksa med encimskim prekurzorjem in proteinskim inhibitorjem Raziskave receptorjev lipopolisaharida v sistemu naravne imunosti - ekspresija in zvitje funkcionalnega rekombinantnega fragmenta CD14 v bakterijah, priprava in izolacija CD14 v P.pastoris - identifikacija peptidnega fragmenta MD-2, ki veže LPS, odkritje njegove antimikrobne aktivnosti - identifikacija MARCKSa kot intraceličnega receptorja za LPS, vloga LPS v depolimerizaciji aktina, določitev vezavnega mesta za LPS na efektorski domeni MARCKSa - ekspresija in zvitje rekombinantnega MD-2 v bakterijah, priprava mutant na osnovi modela 3D strukture Antimikrobne učinkovine - uporaba fragmenta giraze B za načrtovanje novih antimikrobnih učinkovin kot inhibitorjev giraz (NMR, fluorescenca, encimska aktivnost), odkritje flavonoidov kot inhibitorjev ATPazne aktivnosti - identifikacija vezavnega mesta za flavonoide na girazi B - določitev 3D strukture polimiksinov B in E kot prototipnih peptidnih antibiotikov vezanih na LPS - pomemben model za nevtralizacijo endotoksina - priprava rekombinantnih in izotopsko označenih antimikrobnih peptidov v bakterijah v obliki netopnega fuzijskega proteina - izboljšanje antimikrobne in LPS nevtralizirajoče aktivnosti peptidov na osnovi laktoferina (LF11), določitev optimalne dolžine alkilne verige - določitev 3D strukture peptida LF11 v kompleksu z LPS, SDS in DPC micelah - določitev 3D strukture C12 aciliranega LF11 v DPC micelah Uporaba NMR v bioloških sistemih - asignacija in 3D struktura citokroma c P.denitrificans v reduciranem in oksidiranem stanju - določitev interakcij med fragmenti citokrom c oksidaze - določitev mehanizma transporta elektronov v sistemu mitohondijske steroidne dehidrogenaze - določitev 3D strukture RcsB in karakterizacija njegove interakcije z DNA - priprava programa na osnovi originalnega algoritma za avtomatsko asignacijo NMR spektrov na osnovi modela 3D strukture - implementacija metode SNIF-NMR za analizo vin in kombinacija z IRMS, identifikacija aminokislin v vzorcih vin - določanje minornih sestavin v vinih s pomočjo NMR, razširitev pristopa na sokove in olivna olja