Pretežni del aktivnosti raziskovalnega programa ima karakter osnovnih raziskav. Na področju statistične mehanike smo pokazali analogijo med perkolacijskim modelom in spinskimi sistemi na mreži. Za linearne in razvejane polimere smo določili fraktalne eksponente. Na podroćju bioinformatike smo izvedli analize prisotnosti kratkih ponovitev v nukleotidnih zaporedjih. Rezulltate raziskav smo objavili v uglednih mednarodnih znanstvenih časopisih. Sodelavci na programu smo organizirali leta 2000 delavnico "Statistical Mechanics of Complex Systems", ki sta ga financirala Ministrstvo za znanost in tehnologijo Republike Slovenije in Upravni odbor COST D9 projekta, udeležili pa so se je ugledni znanstveniki iz Evrope in Združenih držav Amerike. Člani programske skupine so se udeležili številnih mednarodnih konferenc, kjer so poročali o svojih rezultatih. Z uporabo metod strukturno podprtega načrtovanja učinkovin, ki smo jo v preteklih letih vpeljali v naše raziskave, se je na široki paleti encimskih sistemov, ki so pomembne tarče za razvoj antikoagulantov (trombin), antiproliferativnih spojin (protein tirozin kinaza) in antiinfektivnih spojin (beta laktamaze, DNA giraze), pokazalo, da je možno s ciklično uporabo načrtovanja-sinteze-biološkega testiranja relativno hitro razviti komercialno zanimive spojine. Pomembno je, da je delo podprto s preverjanjem strukture kompleksa encim-inhibitor z metodo rentgenske difrakcije ali NMR. Tako dobimo zelo učinkovit pristop, ki daje uporabne rezultate in je komplementaren uporabi kombinatorne kemije povezane z rešetanjem visoke zmogljivosti, ki so ju uvedli v velikih farmacevtskih hišah po svetu.