Pajek se je veliko bolj uveljavil v tujini, kot pa doma. Kolikor vemo ga uporabljajo v Agenciji za trg vrednostnih papirjev, - v podjetju za zbiranje in analizo podatkov Cati (analiza ankete branosti slovenskih časopisov (čez 100000 anketirancev)), in - posamezni raziskovalci na FDV in EF pri konkretnih analizah podatkov. Pričakujemo, da bodo nekateri razviti algoritmi kombinatorične optimizacije našli uporabo v mobilni telefoniji.