Rezultati programa pomenijo uspešno uvajanje metod sodobne genetike in funkcijske genomike v Slovenijo. Mednarodne povezave, ki izvirajo z dela na programu pomembno doprinašajo v povezanosti nacionalnega raziskovalnega prostora z evropskim. Obravnavanje avtohtonega biološkega materiala (salmonidne vrste, lipicanci) omogoča smotrno ravnanje z živalskimi genskimi viri in hkrati promovira našo naravno dediščino v svetu. Razvoj molekularnih markerjev in njihova uporaba pomeni možnost za učinkovitejše izvajanje programov zaščite ogoroženih populacij, v živinoreji pa odpira vrata za novo generacijo selekcijskih postopkov, ki bodo temeljili na analizi genoma in molekularnih markerjih. Novo znanje na področju antigenske variabilnosti aviarnih mikoplazem daje možnost razvoja novih diagnostičnih sredstev in vakcin za učinkovitejšo zaščito perutnine. To je možnost za industrijo na področju biotehnologije, da izkoristi znanje, ki je že zaščiteno s patenti programske skupine.