Transkriptomska analiza omogoča kompleksno, tkivno specifično analizo izražanja genov v različnih fazah laktacije. Razlike v transkriptomih v različnih tipih celic, različnih stopnjah laktacije in na različnih proizvodnih ravneh omogočajo identifikacijo genov, ki so diferencialno izraženi v različnih fizioloških situacijah. Skrbna izbira biološkega materiala za transkriptomsko analizo laktacije daje dobro možnost za analizo transkriptoma različnih tipov celic v mlečni žlezi med laktacijo. Poleg odkrivanja transkribiranih genomskih regij in kvantifikacije alelno specifičnih transkriptov, transkriptomska analiza omogoča tudi identifikacijo post-transkripcijskih sprememb in odkrivanje transkriptov, ki ne kodirajo proteinov, vendar lahko igrajo pomembno vlogo pri uravnavanju genske ekspresije v mlečni žlezi.
COBISS.SI-ID: 4169352
Ekspresijo estrogenskega receptorja 1 (ESR1) in progesteronskega receptorja (PGR) smo kvantificirali v primarnih kozjih mlečnih epitelijskih celicah (pgMECs), iz tkiva mlečne žleze. Ekspresijo ESR1 in PGR smo detektirali v vseh pgMECs, vendar se je razlikovala med različnimi celičnimi linijami in pogoji rasti. Relativna ekspresija obeh receptorjev je bila najvišja v celičnih linijah, pridobljenih iz juvenilnih živali. Ohranjanje celic v laktogenih pogojih je povzročilo dvig ekspresije ESR1, ki se je gibala od 1,36 do 12,35-krat, in utišanje PGR, ki je bila v razponu od -2,53 do -3,62-krat. Variabilnost relativne in diferencialne ekspresije med pgMECs, ki izvira iz tkiv v podobnem fiziološkem stanju, bi lahko povzročili nenamerna odstopanja v postopku vzpostavljanja celične kulture ali subtilne razlike v fiziološkem stanju donorskih tkiv.
COBISS.SI-ID: 3713928
Prispevek povzema tehnične detajle pri vzpostavljanju primarnih kultur mlečne žleze koze, predstavlja prednosti in vitri modela in opozarja na tehnične težave pri izvedbi poskusov in evalvira biološko relevanco modela.
COBISS.SI-ID: 4105352