V tem članku je podan opis enostavne in hitre metode za proteomsko profiliranje specifičnosti proteaz (fast profiling of protease specificity – FPPS), ki se lahko uporabi tudi na kompleksnih vzorcih. Identifikacija cepitvenih mest z označevanjem N-terminalnih peptidov temelji na tem, da se po tretmaju vzorca s testirano proteazo novonastale N-terminalne peptide označi z trideuteroacetilno skupino, kar omogoči njihovo ločitev od tripsinskih peptidov, ki nastanejo v kasnejši fazi priprave vzorca. Na ta način je z masno spektrometrijo mogoče natančno identificirati cepitveno mesto proteaze in tudi specifične preferenčne aminokisline, ki se v bližini cepitvenega mesta nahajajo. Metodo smo uspešno preverili na cisteinskih katepsinih K, L in S. dobljeni rezultati se tudi zelo dobro ujemajo z uveljavljeno metodo COFRADIC, kar potrjuje primernost metode.
COBISS.SI-ID: 28342823