Lithophaga lithophaga je s pomočjo izločka palialne žleze sposobna raztapljati kalcijev karbonat in posledično dolbsti apnenčaste skale. Molekularni mehanizem, ki omogoča kemično dolbenje je nepoznan. Za identifikacijo genov, ki so potencialno vključeni v mehanizem kemičnega vrtanja, smo izvedli sekveniranje transkriptoma palialne žleze. S sekveniranjem transkriptoma s pomočjo Ion Torrent platforme, smo pridobili 60583 milijonov odčitkov s povprečno dolžino 96 baznih parov. Z de novo sestavljanjem sekvenc v t.i. soseske smo pridobili 62490 sosesk s povprečno dolžino 408 baznih parov. Ker naj bi v kemičnem mehanizmu vrtanja sodelovali proteini s sposobnostjo vezave kalcija, je bilo iskanje kandidatnih genov osredotočeno na transkripte s to sposobnostjo. Skupaj je bilo v palialni žlezi izraženih 178 genov z molekularno funkcijo vezave kalcija. Aneksini, calreticulin, fosfolipaza A2 in H+-ATPaza tipa V, zaradi svoje funkcije in vključenosti v različne biološke procese (transport ionov, celični katabolni proces, zvijanje proteinov) predstavljajo kandidatne gene v kemičnem mehanizmu vrtanja. Rezultat analize transkriptoma je nabor kandidatnih genov, ki so domnevno vključeni posredno ali neposredno v mehanizem kemičnega vrtanja. V nadaljevanju se bo preverilo izražanje izbranih kandidatnih genov in posledično vpletenost v mehanizem kemičnega vrtanja.
COBISS.SI-ID: 8927097