Preučili smo možne dejavnike za vnos E.coli in E.coli z ESBL v matičnih jatah in jatah puranov. V času vzreje smo vzočili organe poginjenih živali, iztrebkov in zraka. Kljub temu, da so bili vsi vzorci okolja pred vselitvijo živali v objekte negativni na prisotnost E.coli z ESBL, smo takšne vzorce potrdili kasneje v času vzreje. V večini primerov so bili pozitivni okoljski vzorci, kar nakazuje na vnos s fecesom in zrakom. Molekularna analiza izolatov, ki smo jih pridobili iz jat z izbruhi kolibaciloze in tistih okoljskih vzorcev, je pokazala, da se statistično značilno pogosteje pojavljajo geni ompT, traT, fyuA irp2 in cvi v vzorcih poginjenih živali.
COBISS.SI-ID: 4052602
Za hitro določanje treh virulenčnih genov za perutnino patogenih Escherichia coli (APEC) smo razvili metodo izotermalno pomnoževanje posredovano z zanko (loop mediated isothermal amplification, LAMP). Uporabnost in delovanje metode smo preverili na setih vzorcev iz dveh lokacij, kjer so se pojavila obolenja tipična za APEC. Analizirali smo različne tipe vzorcev različnih tkiv notranjih organov poginjenih živali, okoljskih vzorcev in brisov živih živali, kjer smo uporabili enostaven postopek lize celic, ki je lahko izvedljiv na terenu samem. Z metodo LAMP smo v času krajšem od 30 minut določili prisotnost vseh treh virulenčnih genov v vzorcih poginjenih živali. Izbrani geni so se pojavljali tudi v vzorcih brisov živih živali in okoljskih vzorcev, vendar v manjši meri. Metoda LAMP se je izkazala kot hitra in zanesljiva metoda za določanje izbranih tarčnih genov na terenu