V sodelovanju z raziskovalno skupino prof. Janeza Plavca s Kemijskega inštituta v Ljubljani smo raziskovali topologijo različnih dolžin reverzne verige (G2C4) heksanukleotidnih ponovitev (G4C2). V nasprotju z dosedanjimi domnevami smo pokazali, da različne dolžine G2C4 zaporedja DNA lahko tvorijo i-motive in protonirane lasnice v pogojih podobnih fiziološkim, ter ne samo v izredno kislih pogojih. Fiziološke pogoje smo simulirali z ustreznim pH, dodatkom kalija ter 40% PEG. V dodatnih poskusih smo pokazali, da ob prisotnosti obeh verig DNA (G4C2 in G2C4) le-ti preferenčno tvorita G-kvadruplekse in i-motive, ne pa dvojnoverižne DNA kot bi pričakovali.
COBISS.SI-ID: 29086759
Z jedrsko magnetno resonanco in cirkularnim dikroizmom smo pokazali, da DNA z različnim številom ponovitev G4C2 tvori planarne gvaninske kvartete, značilne za G-kvadruplekse. Dodatno smo pokazali, da se lahko G-kvadrupleksi tvorijo inter- in intramolekularno v paralelni ali antiparalelni orientaciji, odvisno od dolžine zaporedja. Pri študijah vloge daljših ponovitev G4C2 pri bolezenski patogenezi moramo torej upoštevati potencialno strukturno heterogenost ponovitev.
COBISS.SI-ID: 27972647