Pod mojim vodstvom je doktoriralo pet študentk od tega v zadnjem petletnem obdobju tri. Vse tri doktorandke so doktorirale na področju raziskav aktivacije prirojene imunosti. Izpostavila bi tudi vlogo pri mentorstvu dodiplomskim (magistrskih) študentov ter dijakov, od katerih sta dva za svoje raziskovalno delo prejela Prešernovo nagrado 2014. Poleg mentorstva posameznikom, pa je eden večjih dosežkov vodenje skupine študentov. Kot članica ekipe mentorjev smo vodili dodiplomske študente, ki so se udeležili mednarodnega tekmovanja iz sintezne biologije. Poleg mentoriranja sem vpeta v izobraževalni proces študentov preko predavanj. Na Biotehniški fakulteti Univerze v Ljubljani predavam predmet Zaščita intelektualne lastnine. Na Univerzi v Mariboru, Fakulteti za kemijo in kemijsko tehnologijo in na višji šoli Fizioterapevtika sem predavala izbrane vsebine Mikrobiologija. Viri: Doktorski študentje: FORSTNERIČ V., LEBAR T.; Diplomanti: LEBEN K.; PLAPER T.; KUNŠEK A.; LEBAR, Tina. Načrtovanje genskih regulatornih omrežij na osnovi DNA vezavnih proteinov : doktorska disertacija = Designing gene regulatory circuits based on DNA binding proteins : doctoral dissertation. Ljubljana: [T. Lebar], 2017. XIII, 91, [52] f., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=94274. [COBISS.SI-ID 3867924] FORSTNERIČ, Vida. Vloga domene D0 flagelina pri aktivaciji receptorja TLR5 : doktorska disertacija = The role of the D0 domain of flagellin in activation of TLR5 : doctoral dissertation. Ljubljana: [V. Forstnerič], 2017. X, 89, 18 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=92676. [COBISS.SI-ID 290505216] LEBEN, Katja, KRESE, Rok, PLAPER, Tjaša, FRANKO, Nik, MAGDEVSKA, Lidija, GRADIŠEK, Miha, MERLJAK, Estera, ROŠKAR, Samo, JERALA, Nina, CEROVIĆ, Kosta, PRAZNIK, Arne, PUŠNIK, Žiga. IGEM 2016 : giant jamboree, October 27-31, Hynes Convention Center, Boston, MA. [COBISS.SI-ID 1537310915] LEBEN, Katja. Vpliv povezave ligandov Toll-u podobnih receptorjev na aktivacijo imunskega sistema : magistrsko delo. Ljubljana: [K. Leben], 2016. VI, 43 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 1537134531] PLAPER, Tjaša. Stimulacija inflamasoma NAIP/NLRC4 s flagelinom divjega tipa ter flagelinskimi mutantami : magistrsko delo : magistrski študij - 2. stopnja = Stimulation of inflamasomme NAIP/NLRC4 with wild type flagellin and flagellin mutants : M. Sc. Thesis : Master Study Programmes. Ljubljana: [T. Plaper], 2016. XIV, 70, [3] f., ilustr. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/biologija/du2_plaper_tjasa.pdf. [COBISS.SI-ID 4067663] KUNŠEK, Ana. Vpliv različnih agonistov Tollu podobnih receptorjev na aktivacijo dendritičnih celic : diplomsko delo. Ljubljana: [A. Kunšek], 2015. 33 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 1536474307]
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 3867924Odkrili smo, da je himerni flagelin uporaben kot dodatek vakcinam proti bakteriji Helicobacter pylori. Novost je himerni flagelin, ki je sestavljen iz flagelina bakterije Salmonella thyphimurium, ki aktivira prirojeni imunski odziv in neohranjene domene flagelina bakterije H. pylori, ki služi kot antigen. Himerni flagelin tako v eni molekuli vključuje aktivacijski signal za prirojeni imunski odziv in antigen, kar bistveno izboljša sintezo protiteles proti bakteriji H. pylori. Odkritje smo opisali v publikaciji in zaščitili s patentom. Pokazali smo, da lahko izboljšamo sintezo biosintetskih produktov z urejenim združevanjem biosintetskih encimov na DNA matrici. Inovacijo smo zaščitili s patentom in rezultate objavili v Nucl. Acid. Res. Sodelovanje s tujim podjetjem DSM Food Technologies temelji na opisanem odkritju in odkritju, da lahko z obvitimi vijačnicami nadomestimo DNA ogrodje. Moj prispevek: sodelovanje pri eksperiment je sodelovanje je priprava patentne prijave. Viri: JERALA, Roman, PIRHER, Nina, IVIČAK-KOCJAN, Karolina, AVBELJ, Monika, BENČINA, Mojca, HORVAT, Simon, ČEH, Eva, KOČAR, Vid, KOLAR, Katja, LONZARIĆ, Jan, LASIČ, Ana, MORI, Jerneja, SMOLE, Anže. Chimäre Flagelline für Vakzine : AT 509354 (B1), 2015-05-15. Wien: Österreichisches Petentamt, 2015. 57 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4381466] TURNŠEK, Jernej, ILC, Tina, TOMŠIČ, Nejc, JERALA, Roman, AVBELJ, Monika, BENČINA, Mojca, MORI, Jerneja, STOŠICKI, Tjaša, ŽNIDARIČ, Matej, BORDON, Jure, PETRONI, Mattia, GABER, Rok, KOPRIVNJAK, Tomaž, ANDERLUH, Gregor, VOVK, Irena, GLAVNIK, Vesna. Improved synthesis of biosynthetic product by ordered assembly of biosynthetic enzymes guided by the nucleotide sequence motif template : patent : AT512453 (B1), 2015-05-15. Wien: Österreichisches Petentamt, 2015. 118 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 5480730]
F.32 Mednarodni patent
COBISS.SI-ID: 4381466V zadnjih petih letih sem rezultate naših raziskav s področja prirojene imunosti predstavila na Kongresu Slovenskega Biokemijskega Društva, srečanju Slovenskega imunološkega društva, srečanju Alergologov Slovenije. V obširnejših predavanjih sem naše raziskovalno delo predstavila na Univerzi v Novi Gorici in v sklopu Erasmus predavanj na University of Agriculture, Latvija. Z namenom izboljšanja javne percepcije znanosti in promocije razumevanja znanstvenih odkritji, sem naše dosežke v javnost promovirala skozi intervjuje in javne objave v časopisju. Moja vpetost v mednarodni prostor se kaže z bilateralnimi projekti in neuradnim sodelovanjem s tujimi raziskovalci. Kar nekaj publikacij izvira iz rezultatov mednarodnega sodelovanja (Toivari et al. Metabol Engineer 2012; Valkonen et al. Fungal Genet Biol 2014; Valkonen et al. Appl Environ Microbial 2013; Binder et al. FEBS Lett 2015). Viri: BENČINA, Mojca (intervjuvanec), JERALA, Roman (intervjuvanec). Visokemu šolstvu smo nastavili ogledalo : sodelovanje v oddaji Epilog, POP TV, 15. 10. 2015. BENČINA, Mojca. Kako prepoznati in podpreti potencialno inovacijo : predavanje na Internem izobraževanju za raziskovalce KI z naslovom Od ideje do podjetja, Podjetništvo kot alternativna karierna možnost za raziskovalca, Korak za korakom od raziskovalca do podjetnika, 27. januar 2016. [COBISS.SI-ID 5863962] Priložnost za inovativna podjetja in motivacija za mlade raziskovalce. Finance, ISSN 1318-1548, 13. okt. 2015, št. 199, str. 22. [COBISS.SI-ID 5865498] BENČINA, Mojca. Imunološke zgodbe mladih : vabljeno predavanje na 6. simpoziju Slovenskega imunološkega društva, 15. 12. 2016, Medicinska fakulteta Univerze v Ljubljani. [COBISS.SI-ID 6076954]
D.08 Upravljanje in razvoj raziskovalnega dela
COBISS.SI-ID: 5863962V vlogi predsednice Komisije za inovacije in zastopnice za intelektualno lastnino za Slovenijo in EU aktivno sodelujem pri implementaciji zaščite inovacij na Kemijskem inštitutu in prenosu znanja v gospodarstvo. Pri tem je ena od mojih ključnih dejavnosti ozaveščanje zaposlenih o potencialih intelektualne lastnine in njenih možnostih koriščenja. V ta namen sem skupaj s Pisarno za prenos znanja in gospodarsko zbornico Slovenije organizirala niz predavanj na temo podjetništvo za mlade. Viri: BENČINA, Mojca. Intellectual property and European Patent : lecture at the event From lab to applied science: the industrial biotechnology challenges, University of Nova Gorica, 14. January, 2014. [COBISS.SI-ID 5665050]
F.34 Svetovalna dejavnost
COBISS.SI-ID: 5665050V letih 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2012 in 2016 smo raziskovalci Odseka za sintezno biologijo in imunologijo sestavili ekipo študentov Univerze v Ljubljani, ki je na novem raziskovalnem področju "sintezne biologije" izvedla vsako leto nov raziskovalni projekt na različne teme zdravja in bionanomaterialov. V letih 2006, 2008, 2010, 2012 in 2016 smo osvojili prvo mesto na področju Medicine in zdravja (2007, 2009, 2012), Nanomaterialov (2010) in Osnovnih znanj (2016). Pri dosežku sem sodelovala kot članica mentorske ekipe. Moja vloga v ekipi je bila pomoč študentom pri razvoju ideje, prezentaciji in opisu dosežkov in pomoč pri eksperimentalnih tehnikah mikroskopije in citometrije. Viri: 2016 Sonicell (http://2016.igem.org/Team:Slovenia) LEBEN, Katja, KRESE, Rok, PLAPER, Tjaša, FRANKO, Nik, MAGDEVSKA, Lidija, GRADIŠEK, Miha, MERLJAK, Estera, ROŠKAR, Samo, JERALA, Nina, CEROVIĆ, Kosta, PRAZNIK, Arne, PUŠNIK, Žiga. IGEM 2016 : giant jamboree, October 27-31, Hynes Convention Center, Boston, MA. [COBISS.SI-ID 1537310915]
E.02 Mednarodne nagrade
COBISS.SI-ID: 1537310915