V zadnjih letih je potekalo veliko raziskav na področju razvoja novih naprednih metod z uporabo mikroskopije na atomsko silo (AFM). AFM je po 20 letih razvoja prešel začetne težave in se izkazal kot odlično, če že ne nepogrešljivo orodje za proučevanje pojavov na nanoskali, vključno s kvantitativnimi študijami na posamičnih molekulah. Številne nove metode na osnovi AFM igrajo danes ključno vlogo pri izumu novih zdravil, njihovih dostavnih sistemov, ter pri iskanju novih izvorov bolezni na molekulskem nivoju. Takšne sodobne napredne študije so odličen primer interdisciplinarnega raziskovanja, ki pogosto rezultira v izvrstnih publikacijah in ključnih odkritjih, povezanih z nastankom novih bolezni in pristopov k njihovemu zdravljenju. V tem pregledu smo se osredotočili predvsem na raziskave v zadnjem desetletju. Kljub temu pa nekaterih ključnih preteklih odkritij, ki so osnova za današnji pomen in razširjenost AFM, nismo zaobšli.
COBISS.SI-ID: 19422230
V tej študiji smo razvili novo platformo na osnovi celuloznih substratov za vključevanje analgetikov v medicinske obloge za rane. Kot modelno učinkovino smo uporabili diklofenak (DCF), ki se pogosto uporablja pri zdravljenju bolečine. Celulozni filmi z DCF smo pripravili iz mešanice trimetilsilil celuloze (TMSC) (DSSi: 2,5) z DCF v THF. Po nanosu materiala na trdne substrate s spincoating metodo, smo filme izpostavili param 3 M HCl, kar je vodilo do hidrolize filmov TMSC do celuloze. Sprostitev DCF iz teh filmov po času smo preverjali z UVVis. Pokazali smo, da lahko z dodatno plastjo celuloze brez DCF, bistveno upočasnimo hitrost sproščanja DCF iz teh filmov. Kinetika sproščanja iz teh filmov je zelo podobna kinetiki sproščanja iz viskoznih vlaken impregniranih z DCF, kjer gre za potencialen komercialen material v oskrbi ran. Te študije kažejo potencialno uporabo celuloznih tankih filmih kot modelne platforme za viskozne medicinske obloge v oskrbi ran.
COBISS.SI-ID: 18297110
Dandanes je težko slediti razvoju znanja na področju biomedicine tudi na ožjih strokovnih področjih. Značilen je namreč izjemen porast znanstvenih prispevkov, ki se dnevno objavljajo v revijah. Čeprav so spletni iskalniki in specializirani sistemi za iskanje informacij izrazito napredovali v zadnjih desetletjih, problem natančne avtomatske ekstrakcije znanja iz biomedicinske literature še zdaleč ni rešen. Sistemi za iskanje po navadi vrnejo seznam dokumentov, ki jih je potrebno prebrati, da lahko uporabnik izlušči relevantne informacije. To časovno zahtevno delo pa lahko olajšajo sistemi za odgovarjanje na vprašanja (Question answering systems), katerih cilj je, da uporabniku podajo natančne odgovore na njegova vprašanja. V tem delu podajamo novo metodologijo za odgovarjanje na vprašanja z uporabo semantičnih relacij na biomedicinskem področju. S sistemom za procesiranje jezika SemRep smo pregledali 122.421.765 stavkov iz 21.014.382 bibliografski zapisov iz zbirke MEDLINE (kompleten MEDLINE do leta 2012) in izluščili 58.879.300 semantičnih relacij, ki smo jih organizirali v relacijski bazi podatkov. Aplikacija SemBT, ki išče po omenjeni bazi podatkov, je odprta spletna aplikacija, dostopna na: http://sembt.mf.uni-lj.si. Naredili smo obsežno evalvacijo predlagane metodologije pri kateri je sodelovalo 80 strokovnjakov s področja biomedicine. Skupno so evalvirali 7.510 semantičnih relacij. Natančnost evalvacij je 68%. V tem delu predlagamo in predstavljamo inovativno metodologijo za odgovarjanje na vprašanja v biomedicinskih znanostih. Sistem je implementiran kot spletna aplikacija, ki nam nudi odgovore na različne tipe vprašanj. Odgovor na tipično vprašanje uporabnik prejme v nekaj sekundah. Aplikacija ima določene dodatke, ki so posebej uporabni za DNA mikromreže.
COBISS.SI-ID: 2048297218
Za preživetje v okolju, živilsko-predelovalni in povzročanje bolezni, Campylobacter jejuni zahteva posebne mehanizme za preživetje, kot so formiranje biofilmov, ki pripomorejo k njegovem prenosu skozi prehranjevalno verigo do humanega gostitelja in predstavljajo kritično obliko odpornosti za različne protimikrobne snovi. Fitokemijska analiza etanolnega izvlečka timijana (TE), njegovega preostanka po hidrodestilaciji (TE-R), in izvlečka oljčnih listov (OE) z uporabo tekočinske kromatografije visoke ločljivosti je pokazala, da so glavne sestavine v TE in TE-R flavonski glukuronidi in derivati rožmarinske kisline ter v OE verbaskozid, luteolin 7-O-glukozid in oleurozid. TE in TE-R sta zmanjšala adhezijo C. jejuni na abiotske površine do 30% pri 0.2-12.5 ug ml-1; TE-R pa je imel še bolj izrazit učinek. OE je v koncentracijskem razponu od 3.125 do 200 mcg ml-1 znižal adhezijo C. jejuni na polistiren s 10-23%. Po drugi strani pa je adhezija C. jejuni na PSI celice bila inhibirana za skoraj 30% znotraj velikega koncentracijskega razpona uporabljenih ekstraktov. Naši rezultati kažejo, da TE, odpadni material agroživilske industirje TE-R in stranski produkt OE predstavljajo vir bioaktivnih fitokemikalij, ki so učinkoviti pri nizkih koncentracijah in se lahko uporabljajo kot terapevtska sredstva za preprečevanje bakterijske adhezije.
COBISS.SI-ID: 4558200
Vedno več dokazov nakazuje, da imajo pomembno vlogo za nastanek celikije poleg dednosti tudi drugi okoljski dejavniki, kot je neravnovesje črevesne mikrobiote. Namen naše raziskave je bil ugotoviti vpliv uživanja dveh probiotičnih sevov Bifidobacterium breve BR03 in B. breve B632 na serumsko produkcijo protivnetnega citokina interlevkina 10 (IL-10) in provnetnega citokina dejavnika tumorske nekroze alfa (TNF-α). Raziskava je bila dvojno-slepa, kontrolirana s placebom, v kateri je bilo vključenih 49 otrok s celiakijo na brezglutenski dieti (BGD), ki so bili randomizirani v 2 skupini ter 18 zdravih otrok v kontrolni skupini. Prva skupina (24 otrok s celiakijo) je dnevno 3 mesece uživala B. breve BR03 in B632 2×109 CFU) in druga skupina (25 otrok s celiakijo) je uživala placebo. V prvi skupini so se vrednosti TNF-α 3 mesece po uživanju B.breve značilno znižale. Ob kontroli, 3 mesece po koncu jemanja probiotika, so se vrednosti TNF-α ponovno dvignile. Otroci s celiakijo, ki so bili na BGD pod 1 leto, so imeli podobne izhodiščne vrednosti TNF-α kot otroci s celiakijo na BGD nad 1 leto. Vrednosti IL-10 so bile v vseh skupinah otrok pod mejo detekcije. Uživanje probiotičnih sevov B. breve je imelo pozitivni vpliv na znižanje provnetnega citokina TNF-α pri otrocih s celiakijo na BGD.
COBISS.SI-ID: 512528696