Analizirali smo izražanje genov, ki so povezani z odgovorom na okužbo, in sicer smo s PCR v realnem času merili izražanje genov povezanih s fotosintezo, metabolizmom ogljikovih hidratov in obrambnih odgovorom. Merili smo tudi količino virusa v inokuliranih in neinokuliranih listih. Rezultati so pokazali, da se rastline različno odzivajo na okužbo in da lahko pričakujemo časovni zamik v odgovoru na nivoju izražanja genov. Pokazali smo tudi da je salicilna kislina ključna v obrambnem odgovoru rastline na okužbo in da pomanjkanje le te lahko vodi v razvoj bolezni.
COBISS.SI-ID: 2492751
Glive lahko najdemo v vseh aerobnih okoljih, kjer lahko naselijo različne površine in opravljajo različne funkcije, ki pa niso poznane. Veliko gliv je generalistov in se lahko pojavljajo v vseh okoljih, obstajajo pa tudi specialisti, ki so prisotni samo specifičnih okoljih. Nenavadna okolja za glive so habitati z ekstremnimi pogoji, ki naj bi preprečevali rast glivnih združb. Vendar pa so ravno v teh pogojih prisotne zelo pestre združbe gliv. Opisali smo sestavo glivnih združb v petih ekstremnih pogojih – Antarktične suhe doline, visoki Arktični ledeniki, soline in rastlinski trihomi. V rastlinskih trihomih smo tako našli več še ne opisanih skupin gliv. Z uporabo metod nove generacije sekveniranja lahko odkrivamo sestavo mikrobnih združb v različnih okoljih, vendar pa vloga gliv v teh ekstremnih pogojih še ni znana.
COBISS.SI-ID: 2462031
Razvili in uporabili smo novo metodo za funkcionalno analizo transkriptoma glive, ki omogoča določitev vloge končnega produkta izbranega gena. S to metodo lahko iščemo in določimo gene, ki imajo ključno vlogo za preživetje glive v stresnih okoljih. Metodo smo uporabili za preučevanje halotolerantnosti glive Rhodotorula mucilaginosa in določili ter podrobneje analizirali več genov, ki povečajo halotoleranco netolerantne kvasovke Saccharomyces cerevisiae.
COBISS.SI-ID: 2514255
Krompirjev virus Y predstavlja drugi najpomembnejši patogeni mikroorganizem, ki omejuje proizvodnjo krompirja po vsem svetu, saj vsako leto drastično vpliva na količino in kakovost pridelka. Poznavanje fizioloških sprememb v rastlinah krompirja po okužbi s krompirjevim virusom Y pomaga pri vzgoji novih odpornih sort krompirja in pri splošnem razumevanju interakcije rastlin in patogenih mikroorganizmov. Preučili smo vso dostopno literaturo, ki opisuje interakcijo med krompirjem in krompirjevim virusom Y. Spoznanja in zaključke smo zbrali in opisali v poglavju Physiology of the Potato - Potato Virus Y Interaction, ki je objavljeno v knjigi Progress in Botany, založbe Springer.
COBISS.SI-ID: 2662735