Koloradski hrošč je pomemben škodljivec krompirja v različnih delih sveta. Poznano je, da se uspešno prilagaja na obrambne molekule krompirja z indukcijo novega seta prebavnih proteaz. V okviru te raziskave smo želeli s presejalnimi molekularnimi metodami (subtrakcijske knjižnice, DNA mikromreže) identificirati potencialne ostale ključne gene udeležene v procesu adaptacije. S specifičnimi molekularnimi in biokemijskimi metodami smo pokazali, da v prilagoditvi sodeluje večje število genov, ki kodirajo tako prebavne encime kot regulatorne in obrambne proteine. To znanje prispeva k razumevanju kompleksnosti mehanizma prilagoditve rastlinojedih žuželk na rastlinsko obrambo in ima veliko uporabno vrednost pri nadaljnjih raziskavah večtrofičnih interakcij ter razvoju učinkovitih načinov zatiranja škodljivcev na poljščinah.
COBISS.SI-ID: 3232369
Metode odkrivanja podskupin poiscejo zanimive podmnozice objektov danega razreda. V clanku definiramo generaliziran problem odkrivanja podskupin, s katerim lahko odkrijemo podskupine, ki jih klasicne metode odkrivanja podskupin ne morejo. Za iskanje takih podskupin predlagamo dva koraka odkrivanja podskupin in vmesni korak, kjer definiramo kontrastne mnozice. Ta pristop smo uporabili v biologiji, kjer iscemo zanimive podskupine genov na osnovi ekspresijskih podatkov. Iscemo obogatene mnozice genov, ki so znacilne za vzorce okuzene z virusom v specificnih casovnih tockah oz. za specificne fenotipe. Porocamo o eksperimentalnih rezultatih na osnovi casovne vrste ekspesijskih podatkov za krompir (Solanum tuberosum), okuzen z virusom. Odkrite podskupine, ki opisujejo odziv krompirja na okuzbo z virusom predstavljajo nove raziskovalne hipoteze, potencialno zanimive za biologijo rastlin.
COBISS.SI-ID: 26152487