Člani projektne skupine so vodili ali so bili vključeni v tehnološko zahtevne raziskave za različne industrijske partnerje (tovarna zdravil Lek, tovarna zdravil Krka, BIA Separations, Omega in drugi). Kristina Gruden je vodila je delovni paket v Kompetenčnem Centru BRIN, aktivno pa je sodelovala tudi v Centru Odličnosti COBIK. Sodelovanje je vodilo v razvoj platforme za izboljšanje farmacevtskih proizvodnih sevov in postopkov. Z uporabo le-te smo identificirali regulator biosinteze eritromicina [Kirm et al.,2013; COBISS.SI-ID 3005775]. Identificirali smo tudi markerje, ki napovedo stabilnost in produktivnost rekombinantnih celičnih linij, kar je vodilo v prijavo dveh evropskih patentov [European Patent Office, 14192809.3 and 14192810.1; COBISS.SI-ID 3342159, COBISS.SI-ID 3342415].
F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso
COBISS.SI-ID: 3342159Člani projektne skupine smo z namenom popularizacije znanosti sodelovali z različnimi mediji. Nastopili smo v televizijskih in radijskih intervjujih ter sodelovali pri pripravi dveh poljudnih televizijskih oddajah in drugih dogodkov, namenjenih popularizaciji znanosti (Dan očarljivih rastlin, Noč raziskovalcev, Festival znanosti, Znanost na cesti, BioBash). V oktobru 2014 smo v Ljubljani v okviru evropskega infrastrukturnega projekta ISBE organizirali poljudno delavnico “Sistemska biologija, njen vpliv na znanost, gospodarstvo, družbo in posameznika kot celoto”.
F.18 Posredovanje novih znanj neposrednim uporabnikom (seminarji, forumi, konference)
COBISS.SI-ID: 30556633Kristina Gruden aktivna članica različnih mednarodnih strokovnih odborov. Je članica uredništva priznanih mednarodnih revij “BMC Plant Biology” in “Molecular genetics and genomics” ter področni urednik revije “Frontiers in Physiology” (od 2012). Nada Lavrač je članica uredniškega odbora priznane revije s področja računalniških znanosti “Data mining and knowledge discovery« in še šestih drugih revij. Blaž Zupan je čalen uredniškega odbora revij »BMC Cancer«, »Current bioinformatics« in »IEEE transactions on information technology in biomedicine«. Kristina Gruden je bila nedavno izvoljena kot članica odbora za štipendije združenja evropskih biokemijskih društev (FEBS). Je tudi članica upravnega odbora projekta 7OP (ESFRI) ISBE (2012-), ki je namenjen vzpostavitvi evropske infrastrukture za sistemsko biologijo. Prof.Blejec je bil leta 2013 izvoljen za predsednika International Association for Statistics Education.
D.03 Članstvo v tujih/mednarodnih odborih/komitejih
Jedro projektne skupine Kristina Gruden, Nada lavrač in Blaž Zupan so profesorji na Univerzi v Ljubljani, Univerzi v Novi Gorici in na Mednarodni Podiplomski Šoli IJS in učijo tako na dodiplomski kot tudi na podiplomski stopnji. Kot učitelji so gostovali tudi na tujih univerzah. Trenutno so mentorji skupno 20 doktorandov s katerimi odpirajo nova raziskovalna področja. Ana Rotter je za razvoj novih pristopov za analizo in vizualizacijo transkriptomskih podatkov v okviru svojega doktorskega dela prejela nagrado UNESCO-L´OREAL za ženske v znanosti (2011). Doktorandka Živa Ramšak, je nedavno objavila članek z novega področja ontologije rastlinskih genov v reviji Nucleic Acid Research (IF=8.8, A'').
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 757111Nada Lavrač je vodja Odseka za tehnologije znanja Instituta Jožef Stefan in programske skupine Tehnologije znanja, ki je v 6. in 7. OP EU sodeloval in sodeluje v 28 evropskih projektih in je tako po vključenosti v evropske projekte najuspešnejša programska skupina v Sloveniji. Kristina Gruden je vodja delovne enote 'Omski pristopi' na Oddelku za biotehnologijo in sistemsko biologijo na Nacionalnem inštitutu za biologijo (vodi 17 raziskovalcev) in vključena v številne mednarodne projekte. Blaž Zupan je vodja Bioinformatskega laboratorija na Fakulteti za računalništvo Univerze v Ljubljani (vodi 16 raziskovalcev), ki je vključen v številne domače in tuje projekte.
D.01 Vodenje/koordiniranje (mednarodnih in domačih) projektov
COBISS.SI-ID: 24434983