Pri pojasnjevanju gastroenteritisne etiologije pri hospitaliziranemu otroku z drisko smo dokazali nov reovirus pri ljudeh, ki so ga v istem obdobju dokazali še pri netopirjih v Nemčiji in Italiji. V objavljenem raziskovalnem članku smo prikazali hiter in učinkovit pristop pri dokazovanju virusov neznane etiologije z uporabo klasičnih viroloških in moderne molekularne metode. Opisali smo tudi nov princip predpriprave kliničnega vzorca, koncentriranje in čiščenje virusov s kromatografsko metodo, ki omogoča najboljši izplen tarčnih nukleotidnih zaporedij pri naslednji generaciji sekvenciranja.
COBISS.SI-ID: 2886735
V prispevku smo opisali analizo celotnega genoma rotavirusnega seva, ki smo ga dokazali pri otroku z drisko. Po osnovni tipizaciji smo dokazali genotip G6P[11], ki se najpogosteje pojavlja pri govedu. Po analizi nukleotidnega zaporedja vseh genomskih odsekov smo dokazali, da je rotavirusni sev povzročil okužbo pri otroku po neposrednem prenosu, najverjetneje iz goveda na otroka. Filogenetska analiza ni potrdila prerazporejanje genoma.
COBISS.SI-ID: 30182617
V raziskavi primerov in kontrol smo hoteli pojasniti vlogo koronavirusov pri otrocih z gastroenteritisom. V preiskavo je bilo vključenih 260 primerov in 157 kontrol (zdravih otrok). Koronaviruse smo dokazovali v vzorcih brisa nosnega žrela in v iztrebkih otrok z molekularnimi metodami. Ugotovili smo, da se koronavirusi pojavljajo pogosteje pri otrocih z drisko kot pri zdravih kontrolah (23/260, 8.8% pri primerih in 4/151, 2.6% pri kontrolah; OR 3.3; 95% interval zaupanja, CI 1.3–10.0; P = 0.01). Zaradi višje pojavnost koronavirusov v vzorcih respiratornega trakta in hkratne detekcije dodatnih virusnih patogenov v iztrebkih skupaj s koronavirusi, sklepamo, da imajo koronavirusi le manjšo vlogo pri gastroenteritisih otrok do 6. leta starosti.
COBISS.SI-ID: 30419417