Ivičak-Kocjan, K, Panter, G, Benčina, M*, Jerala, R*. Determination of the physiological 2:2 TLR5:flagellin activation stoichiometry revealed by the activity of a fusion receptor. (Biochem biophys res commun 2013, 435. [5222426], IF1.95). Vodja projekta si deli vlogo odgovornega avtorja. Pokazali smo fiziološko pomembno stehiometrijo 2:2 med TLR5 in flagelinom z uporabo himernega proteina sestavljenega iz aktivnega fragmenta flagelina povezanega na N-terminalnem koncu s TLR5 (SF-TLR5). Ta himerni protein je konstitutivno aktiven. Z dodajanjem divjega tipa hTLR5 smo znižali avtoaktivacijo SF-TLR5, v odvisnosi od koncentracije. Učinek smo inhibirali z dodatkom flagelina bakterije S. typhimurium, kar kaže na biološko aktivnost TLR5: flagelina kompleks z 2:2 stehiometrijo. Ti rezultati, poleg kombinacije mutacij neaktivnega P736H v BB-zanki domene TIR pri TLR5 in SF-TLR5, dodatno potrjujejo mehanizem aktivacije receptorja TLR5. KIK, GB sta izvedli eksperimente, MB je analizirala rezultate in delo vodila. MB in RJ sta napisala članek. Delo smo predstavili na predavanju: Molecular mechanism of TLR5 activation by flagellin (Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation [36980229]).
COBISS.SI-ID: 5222426
Pohar J, Pirher N, Benčina M, Manček Keber M, Jerala R*. The role of UNC93B1 protein in surface localization of TLR3 receptor and in cell priming to nucleic acid agonists. (J Biol Chem 2013, 288, [5143066] [IF4.651, 2 citations]) smo pokazali, da povečano izražanje UNC93B1 povzroči transport različno glikoziliranih TLR3 na plazmesko membrano, kar pa ne drži za preostale NAS TLRs. Iz naših spoznanj izhaja, da je receptor TLR3 pomemben za regulacijo UNC93B1, ki uravnava odzivnost vseh NAS TLRjev.
COBISS.SI-ID: 5143066
Gradišar H, … Hafner Bratkovič I, … Jerala R*. Design of a single-chain polypeptide tetrahedron assembled from coiled-coil segments. (Nature Chem Biol 2013, 9 [5222682], [IF12.95, 8 citations]); avtorji so predstavili strategijo za oblikovanje samo-sestavljivih polipeptidnih nanostruktur, ki temelji na modularnosti ortagonalnih dimerizacijskih segmentov. Zasnovali in eksperimentalno so dokazali tvorbo tetraedra, ki se je samostojno sestavil iz ene polipeptidne verige, ki vsebuje 12 samosestavljivih segmentov, ki so bili ločeni s fleksibilnim peptidnim segmentom. Ta platforma je temelje za gradnjo novih polipeptidnih topologij na podlagi ortogonalnih polipeptidnih segmentov. Delo smo predstavili na predavanjih: Imperial College, London, UK, 2013 [5340698], Alpbach, Austria 2013 [36977925], Málaga 2013 [5388826]
COBISS.SI-ID: 5222682