Vaccine 30, 2012. [5023770, IF 3.492, 7 citations]; Mori J, ....,, Benčina M, Jerala R*. Chimeric flagellin as the self-adjuvanting antigen for the activation of immune response against Helicobacter pylori. Infekcija z bakterijo H. pylori lahko povzroči gastritis in vodi do raka na želodcu. Dolgotrajna antibiotična terapija ne ščiti gostitelja pred ponovnimi infekcijami. Bakterija H. pylori se je tekom evolucije prilagodila tako, da se uspešno izogiba imunskemu odzivu. TLR5, član družine Tollu podobnih receptorjev, prepoznava flageline večine bakterij, vendar ne flagelina FlaA bakterije H. pylori. Z genskim inženiringom smo pripravili himerni flagelin, ki je bil sestavljen iz terminalnih regij E. coli in centralnega dela H. pylori. Rekombinanten flagelin je pravilno zvit in aktivira TLR5. V miših vakciniranih s himernim flagelinom smo izmerili povečano sintezo protiteles IgG in IgA. Protitelesa so se vezala na flagelin H. pylori. Vakcinacija s himernim flagelinom je zagotovila pomembno zaščito miši pred kolonizacijo s H. pylori.
COBISS.SI-ID: 5023770
Biochem biophys res commun 2013, 435. [5222426, IF 1.95, 1 citation]; Ivičak-Kocjan, K, Panter, G, Benčina, M*, Jerala, R*. Determination of the physiological 2:2 TLR5:flagellin activation stoichiometry revealed by the activity of a fusion receptor. Vodja projekta si deli vlogo odgovornega avtorja. Pokazali smo fiziološko pomembno stehiometrijo 2:2 med TLR5 in flagelinom z uporabo himernega proteina sestavljenega iz aktivnega fragmenta flagelina povezanega na N-terminalnem koncu s TLR5 (SF-TLR5). Ta himerni protein je konstitutivno aktiven. Z dodajanjem divjega tipa hTLR5 smo znižali avtoaktivacijo SF-TLR5, v odvisnosi od koncentracije. Učinek smo inhibirali z dodatkom flagelina bakterije S. typhimurium, kar kaže na biološko aktivnost TLR5: flagelina kompleks z 2:2 stehiometrijo. Ti rezultati, poleg kombinacije mutacij neaktivnega P736H v BB-zanki domene TIR pri TLR5 in SF-TLR5, dodatno potrjujejo mehanizem aktivacije receptorja TLR5. KIK, GB sta izvedli eksperimente, MB je analizirala rezultate in delo vodila. MB in RJ sta napisala članek. Delo smo predstavili na predavanju: Molecular mechanism of TLR5 activation by flagellin (Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation [36980229]).
COBISS.SI-ID: 5222426
Blood 124. 2014. doi: 10.1182/blood-2014-05-573188; Avbelj M, …, Benčina M, …, Jerala R*.. Mutacija Leu265Pro proteina MyD88 ustvarja pogoje za preživetje limfomnih celic. Pokazali smo, da je posledica mutacije proteina MyD88 agregacija proteina in konstitutivna aktivacija transkripcijskega faktorja NF-kB. Pokazali smo, da alosterična oligomerizacija vodi do konstitutivne aktivacije, ki jo je mogoče preprečiti z ustreznimi peptidinimi inhibitorji.
COBISS.SI-ID: 5607194
J Biol Chem 2013, 288, [5143066] [IF4.651, 2 citations]; Pohar J, Pirher N, Benčina M, Manček Keber M, Jerala R*. The role of UNC93B1 protein in surface localization of TLR3 receptor and in cell priming to nucleic acid agonists. Pokazali smo, da povečano izražanje UNC93B1 povzroči transport različno glikoziliranih TLR3 na plazmesko membrano, kar pa ni lastno preostalim NAS TLR-jem (TLR7/8, TLR9). Iz naših spoznanj izhaja, da je receptor TLR3 pomemben za regulacijo izražanja UNC93B1, ki uravnava odzivnost vseh NAS TLRjev. JP, NP, MB, MMK smo izvedli eksperimente, MB je vodila eksperimente in izvedla mikroskopijo. RJ je podal idejo, JP in RJ sta pripravila tekst za članek. Spremljajoče publikacije: (B) PloS one 2014, 9, doi: 10.1371/journal.pone.0092391. [5462042, IF 3.534]; Pohar J, ..., Benčina M, ..., Jerala R. 2014. The ectodomain of TLR3 receptor is required for its plasma membrane translocation. Dela smo predstavili na predavanjih: Annual meeting of the Austrian society for allergology and immunology, Vienna, 2010 [4577562], IEIIS Edinburgh 2008, University of Cambridge, 2008 [4033306]; German Cancer Research Centre, 2010 [4575770]
COBISS.SI-ID: 5143066
J Biol Chem 2012, 287, [5026586, IF 4.65, 2 citations]; Fekonja O, Benčina M, Jerala R*. Toll/interleukin-1 receptor domain dimers as the platform for activation and enhanced inhibition of Toll-like receptor signaling. Avtorji smo pokazali vlogo TIR (Toll/IL-1 receptor) dimerizacijske domene kot osnovo za inhibicija ali aktivacijo MyD88 signalnih poti. Dodatek uvite vijačnice dimerizacijski domeni izboljša inhibicijo proti družini receptorjev TLR in prepreči konstitutivno aktivacijo preko TIR dimerizacije. Avtoji so predlagali molekulski model MyD88-odvisne signalizacije v povezavi s TIR dimerizacijskimi domenami. OF in MB sta izvedli eksperimente. MB je izvedla mikroskopsko analizo. OF in RJ sta pripravila članek. Spremljajoče publikacije: (A) J Immunol 2012, 188 [4930586, IF 5.745, 2 citations]; Manček Keber M, Benčina M, …, Jerala R*. MARCKS as a negative regulator of lipopolysaccharide signaling.
COBISS.SI-ID: 5026586