Metoda za povečano proizvodnjo rekombinantnih proteinov v rastlinah ali rastlinskih celic rešuje problem kompleksne proizvodnje beljakovin s hitro, zanesljivo in ekonomsko upravičeno rešitvijo. V rastline N. tabacum (ali druge) je potrebno vstaviti vsaj en protein, ki ga sestavlja zaporedje za beljakovino, ki se proizvaja, in vsaj en protein, sestavljen iz zaporedja vsaj eno dodatno beljakovino ali poliribonukleotid, ki poveča celično prepustnost, po možnosti iz skupine glikozidaz, ali če je uveden vsaj en protein, ki zajema zaporedje želenega proteina in zaporedje za povečanje prepustnosti ciljnih celic, po možnosti iz skupine glikozidaz. Zaporedja po možnosti izhajajo iz rastlinskih virusov, po možnosti TMV in / ali PVX.
F.33 Patent v Sloveniji
COBISS.SI-ID: 2483279Predavanje je bilo izvedeno v okviru delavnice »Training course on molecular diagnostics for risk assessment and management of genetically modified crops«, ki jo je v New Delhiju organiziral National Bureau of Plant Genetic Resources, Indian council of agricultural research. Tema predavanja je bila predstavitev temeljnih raziskav interakcije krompir-virus in kako lahko takšne raziskave privedejo do aplikativnih rezultatov.
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 2489935S pristopom funkcijske analize genov smo ovrednotili vlogo gena za β-1,3-glukanazo razreda III (Glu-III) v interakciji med krompirjem in krompirjevim virusom YNTN (PVYNTN). Pripravili smo transgene rastline s povečanim izražanjem Glu-III. Po okužbi s PVYNTN smo ugotovili razlike v širjenju virusa med transgenimi linijami s povečanim izražanjem Glu-III in netransgenimi linijami. Razlike, ki sovpadajo s hitrejšim širjenjem virusa med linijami, smo ugotovili tudi na nivoju izražanja genov, kjer smo opazovali izražanje izbranih markerskih genov. Razvili smo tudi novo metodo za določanje gensko spremenjenih organizmov (GSO) imenovano NAIMA (ang. NASBA Implemented Microarray Analysis).
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 261457920Z metodami funkcijske genomike smo ovrednotili vlogo z mitogeni aktiviranih proteinskih kinaz (MAPK) v odzivu netransgenega krompirja sorte Rywal (preobčutljivostni odziv) in transgenega NahG-Rywala (okvarjena sinteza salicilne kisline) na okužbo s krompirjevim virusom Y (PVY). Signalizacija MAPK je eden ključnih regulatorjev odziva rastline na napad patogenov. Sproži se po principu kaskade, v kateri so aktivirane tri kinaze, rezultat pa je aktivacija obrambnih genov in proteinov. Negativni regulatorji kaskade so fosfataze MAPK. Prikazali smo filogenetske odnose krompirjevih MAPK in ortologov modelne rastline A. thaliana in ugotovili slabšo zastopanost teh genov v krompirju. Rezultati izražanja genov netransgenega krompirja sorte Rywal in transgenega NahG-Rywala po okužbi s PVY kažejo tri različne vzorce izraţanja, najpogosteje imajo geni v primerjavi s kontrolami v krompirju sorte Rywal nižje, v krompirju NahG-Rywal pa višje izražanje. Za nadaljnje funkcijske analize smo izbrali tri diferencialno izraţene gene: MAPK kinazo 6 (MKK6), MAPK (z ranitvijo inducirana proteinska kinaza, WIPK) in fosfatazo MAPK 1 (MKP1). Preučevali smo tudi vpliv virusa PVY na lokalizacijo izbranih treh proteinov. Ugotovili smo, da se protein MKK6 pod kontrolo nativnega promotorja ob okužbi s PVY nakopiči v jedru. Z metodo BiFC (bimolekularna fluorescenčna komplementacija) nismo našli potencialnih substratov proteina StMKK6. Vpliv utišanja gena StWIPK s prehodno transformacijo rastline S. venturii na hitrost širjenja fluorescenčno označenega virusa ni vplival.
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 818039V oddaji smo predstavili prehodne transformacije rastlin in kako spremenimo izražanje genov v rastlinah. Poleg praktičnega prikaza lokalizacijskih študij, smo prikazali tudi možnost rastlinske proizvodnje proteinov (npr. za proizvodnjo cepiv).
B.06 Drugo
COBISS.SI-ID: 2771279