V zadnjih letih je veliko raziskav usmerjenih v iskanje novih protiglivnih tarč. Ena takih je tudi glivni citokrom CYP53, družina visoko konzerviranim proteinov, ki je prisoten v številnih patogenih glivah, kot so Aspergillus fumigatus in Gibberella zeae. V naši raziskavi smo ugotovili, da benzoat para-hidroksilaza (CYP53A15 ali BPH sodeluje pri razstrupljanju benzoata, ključnega vmesnega metabolita pri presnovi aromatskih spojin v glivi. Visoka specifičnost in odsotnost homologa pri višjih evkariontih opredeljujejo CYP53A15 kot zanimivo tarčo za razvoj protiglivnih učinkovin. Prav tako smo pokazali zaviranje CYP53A15 z naravnimi spojinami, kot so isoeugenol, timol, trans-cimetova kislina in dokazali njihov protiglivni potencial. Med testiranimi 25 derivatov cimetne kisline smo pokazali, protiglivno delovanje 4 spojin. Dva od njih sta zavirala delovanje encima CYP53A15 in sta bila izbrana za nadaljnjo optimizacijo novih protiglivnih spojin.
COBISS.SI-ID: 5192218
Glivni encimi CYP53 so zelo ohranjeni proteini, ki sodelujejo pri razstrupljanju fenolnih spojin in nimajo homologov pri višjih evkariontih, zaradi česar predstavljajo dobro tarčo za protiglivna sredstva. Z namenom, da odkrijemo nove inhibitorje CYP53 smo uporabili dva vzporedna virtualna protokola presejanja in ovrednotenja najboljših spojin. Z analizo spektralnih vezavnih interakcij in testiranja zaviranja katalitične aktivnosti encima ter z analizo protiglivnega delovanja smo izbrali 3-metil-4-(1H-pyrrol-1-il) benzojsko kislino (spojina 2), kot najboljšega kandida za nadaljno odkrivanje protiglivnih spojin.
COBISS.SI-ID: 30257369
V predstavljenem delu, smo zgradili zanesljiv strukturni homologni model CYP53A15 za izvajanje virtualnega pregleda in molekulskega sidranja knjižnice spojin v aktivno mesto. Spojine so bili izbrane gledena molekulsko maso, število obročnih sistemov, hetero atomov, donorjev ali akceptorjev H-vezi, interakcije z železom v hemu. 40 spojin smo obvrednotili s funkcijskimi testi, kot je CO-diferenčni specter, RP-HPLC analizo. Spojine so bile testirane tudi in vivo s testom zaviranja glivne rasti. Na podlagi dobljenih rezultatov smo Izbrali smo spojine I26, I30 kot spojini vodnici za nadaljne študije protiglivnega delovanja.
COBISS.SI-ID: 5192474