Molekularni model aktivnega homodimera TLR4/MD-2/LPS, predlagan s strani naše raziskovalne skupine, ki je bil kasneje potrjen z določeno kristalno strukturo, predstavlja dobro osnovo za študij molekularnega mehanizma negativne regulacije TLR4 signalne poti preko kompleksa RP105/MD-1. LPS se kot monomer preko lipida A veže v hidrofobni žep proteina MD-2, kar povzroči dimerizacijo membranskega receptorja TLR4 preko dveh vezavnih mest na zunajcelični domeni TLR4. Glede na homologijo med paroma RP105/MD-1 in TLR4/MD-2 ter znanimi biokemijskimi podatki smo predlagamo hipotezo, da omenjena para tvorita heterotetramer RP105/MD-1:TLR4/MD-2 v katerem ne more priti do dimerizacije TIR domen. Na podlagi predvidevanj, da je kontakt med MD1-TLR4 in MD-2-RP105 podoben geometriji proteinskih enot aktivnega tetramera (TLR4/MD-2)2, smo predlagali molekularen model heterotetramera RP105/MD-1:TLR4/MD-2. Za potrditev naše hipoteze smo pripravili himerni protein, ki ima na ECD RP105 vezano TIR domeno TLR4. Pokazali smo, da je himera še boljši inhibitor TLR4 signalne poti kot sam RP105, kar kaže na to, da razlog za inhibitoren učinek RP105 ni le v odsotnosti TIR domene. Na podlagi naših eksperimentalnih rezultatov smo pripravili izbolšan molekularni model interakcije RP105/MD-1 z TLR4/MD-2.
COBISS.SI-ID: 4829210