V prispevku, predstavljenem na mednarodni konferenci, smo pokazali učinkovitost oksidacije različnih ligninskih substratov in fenolnih monomerov ter njihovo polimerizacijo, ki smo jo sledili s spektroskopijama FTIR in XPS, polielektrolistko titracijo in ciklično voltametrijo.
COBISS.SI-ID: 16659734
Članek objavljen v priznani reviji PlOS one prvič prinaša vpogled v raznolikost genov, ki kodirajo proteine z značilnostmi bakterijskih lakaz. In sicer smo prvi an svetu iskali te gene v 2200 delnih in dokončanih bakterijskih genomih ter štirih metagenomskih podatkovnih bazah s pomočjo modelov, ki smo jih sami razvili (skriti modeli Markova) za iskanje dvo- in trodomenskih lakaz. Našli smo preko 1200 potencialnih genov za te encime, od katerih je 76 % kodiralo signalni peptid – to pomeni, da se ti encimi v naravi izločajo iz citoplazme, kar je v nasprotju s trenutnim prepričanjem. Poleg tega smo opisali nekaj pokazateljev horizontalnega prenosa the genov med bakterijskimi vrstami. Številnih metagenomskih zaporedij lakaznih genov nismo mogli filogenetsko uvrstiti, kar nakazuje veliko novost the genov. Gene za lakaze smo našli tudi v anaerobnih bakterijah, avtotrofnih in alkalifilnih organizmih, kar odpira nove hipoteze o ekoloških vlogah the encimov. Delo je bilo citirano v Google scholar 19 krat.
COBISS.SI-ID: 3993720
To je pionirsko delo objavljeno v najboljši reviji (1/31 na področju pedologije) o diverziteti bakterijskih lakaz v tleh v katerem smo pokazali, da so bakterijske lakaze široko razširjene in bi lahko bile pomembnejše kot glivne lakaze za razgradno fenolnih spojin. Dizajnirali smo tudi nov par oligonukleotidnih začetnikov s katerim smo prvi na svetu uspeli pomnožiti gene za tro kot tudi dvo domenske lakaze iz tal. To kaže, da je naš pristop uporaben za preučevanje bakterijskih lakaz v okolju kot tudi v bakterijskih sevih.
COBISS.SI-ID: 3874680
V prispevku, predstavljenem na mednarodni konferenci, smo pokazali učinkovitost oksidacije različnih ligninskih substratov in fenolnih monomerov ter njihovo polimerizacijo, ki smo jo sledili s spektroskopijama FTIR in XPS, polielektrolistko titracijo in ciklično voltametrijo.
COBISS.SI-ID: 16657686
V delu je dobršen del posvečen delovanju lakaze v prisotnosti fenolnim podobnih substanc. V delu so uporabljene kemijske in fizikalne metode za karakterizacijo katalitskega delovanja lakaz ter za opis kinetike in končnih produktov delovanja teh encimov na različne fenolne substance. Poznavanje metod in pridobljeno znanje o delovanju lakaz sta bili potrebni osnovi za uporabo teh encimov pri funkcionalizaciji lignoceluloznih površin.
COBISS.SI-ID: 2159753