let-7 miRNK molekule uravnavajo časovni potek razvoja črva C. elegans. Dvakrat se vežejo na 3’-neprevedljivo regijo lin-41 mRNK molekul in zmanjšajo izražanje. V članku opisujemo določitev strukture 34-mernega RNK konstrukta s pomočjo NMR v tekočem. Struktura, ki posnema interakcijo let-7 miRNK na prvo komplementarno vezavno mesto, kaže dve ne-kanonični regiji: nesimetrično notranjo zanko in izboklino. V notranji zanki sta G23 in U25 obrnjena navzven, medtem ko je nukleinska baza U24 obrnjena navznoter. Izbočena nukleinska baza A30 se ne veže znotraj vijačnice, ampak je obrnjena v mali žleb.
COBISS.SI-ID: 4554778
V tem preglednem članku opisujemo pripravo 33-mernega RNK modelnega konstrukta, ki posnema vezavo med let-7 miRNK in lin-41 mRNK na drugem vezavnim mestu (LCS2). Razložimo NMR eksperimente, ki smo jih uporabili za asignacijo 1H, 13C, 15N in 31P resonanc ter za določitev NOE omejitev in omejitev torzijskih kotov. Strukturni izračuni so pokazali, da se 13C,15N-označen RNK konstrukt zvije v stabilno strukturo, sestavljeno iz dveh stebelnih regij ločenih z definirano nesimetrično notranjo zanko. NMR v tekočem pomembno prispeva k globljemu razumevanju o strukturnih lastnostih miRNK:mRNK kompleksov.
COBISS.SI-ID: 4508698