let-7 miRNK uravnavajo časovni potek razvoja črva C. elegans. Na 3’-UTR lin-41 mRNK se vežejo dvakrat in močno znižajo izražanje gena. V članku smo opisali določitev strukture 34-nt RNK konstrukta s pomočjo NMR spektroskopije v tekočem. Struktura, ki posnema interakcijo let-7 miRNK na prvo komplementarno vezavno mesto, kaže dve ne-kanonični regiji, to sta nesimetrična notranja zanka in adeninska izboklina. V notranji zanki sta G23 in U25 obrnjena navzven, medtem ko je nukleinska baza U24 obrnjena navznoter. Izbočena nukleinska baza A30 se ne veže znotraj vijačnice, ampak je obrnjena v mali žleb.
COBISS.SI-ID: 4554778
V tem preglednem članku opisujemo pripravo 33-nt RNK konstrukta, ki predstavlja vezavo med let-7 miRNK in lin-41 mRNK na drugem vezavnim mestu (LCS2). Razložimo NMR eksperimente, ki smo jih uporabili za določitev kemijskih premikov 1H, 13C, 15N in 31P resonanc ter za omejitev medprotonskih razdalj in torzijskih kotov. Strukturni izračuni so pokazali, da se izotopsko označen RNK zvije v stabilno strukturo sestavljeno iz dveh stebelnih regij ločenih in z dobro definirano nesimetrično notranjo zanko. NMR v tekočem pomembno prispeva k globljemu razumevanju o strukturnih lastnostih miRNK:mRNK kompleksov.
COBISS.SI-ID: 4508698