V okviru projekta smo vzpostavili metodologijo za celostno proučevanje bioloških sistemov. Ta obsega poleg analiz transkriptoma, tudi analize proteoma in metaboloma. Za kvalitetno analizo in integracijo podatkov pa razvijamo metode biostatistike in bioinformatike. Za tak pristop v bioloških raziskavah je veliko zanimanje tudi v industriji, saj imamo s farmacevtsko industrijo sklenjenih več pogodb za vrednotenje proizvodnje zdravil in odkrivanje novih zdravilnih učinkovin. Kot član Centra kompetenčnosti KC-BRIN s pomočjo orodij sistemske biologije podpiramo razvoj slovenske biotehnološke industrije.
F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso
COBISS.SI-ID: 2229327Z namenom komercializacije in razvoja znanja s področja sodobnih molekularnih tehnik v biotehnologiji in sistemski biologiji, ki izhajajo iz Nacionalnega inštituta za biologijo, smo v letu 2010 ustanovili spin-out podjetje Biosistemika d.o.o. Podjetje je usmerjeno k zagotavljanju celostnih rešitev za uporabnike zahtevnih laboratorijskih analiz s področja molekularne biologije. Od ustanovitve podjetje sodeluje z NIB na področju organizacije delavnic s področja PCR v realnem času in razvoja produktov za molekularno diagnostiko.
F.20 Ustanovitev novega podjetja ("spin off")
COBISS.SI-ID: 2363215Projektna skupina je bistveno prispevala k popularizaciji znanosti z objavo članka v slovenskem jeziku v reviji, ki dosega širok krog bralcev [COBISS.SI-ID 562248]. Poleg tega so sodelovali v več radijskih oddajah [COBISS.SI-ID 27882201, COBISS.SI-ID 29507801, COBISS.SI-ID 28366297 in COBISS.SI-ID 29507545] in pri pripravi razstave [COBISS.SI-ID 25092569]. Sodelovali so tudi pri izvedbi dogodkov za popularizacijo znanosti, s predavanji in predstavitvijo raziskovalnega del na 17. Festivalu znanosti (Ljubljana, 4.-6.10.2011) in v okviru Mednarodnega Dneva Očarljivih rastlin (Botanični vrt Ljubljana, 18.5.2012).
F.18 Posredovanje novih znanj neposrednim uporabnikom (seminarji, forumi, konference)
COBISS.SI-ID: 562248Metoda za povečano proizvodnjo rekombinantnih proteinov v rastlinah ali rastlinskih celic rešuje problem kompleksne proizvodnje beljakovin s hitro, zanesljivo in ekonomsko upravičeno rešitvijo. V rastline N. tabacum (ali druge) je potrebno vstaviti vsaj en protein, ki ga sestavlja zaporedje za beljakovino, ki se proizvaja, in vsaj en protein, sestavljen iz zaporedja vsaj eno dodatno beljakovino ali poliribonukleotid, ki poveča celično prepustnost, po možnosti iz skupine glikozidaz, ali če je uveden vsaj en protein, ki zajema zaporedje želenega proteina in zaporedje za povečanje prepustnosti ciljnih celic, po možnosti iz skupine glikozidaz. Zaporedja po možnosti izhajajo iz rastlinskih virusov, po možnosti TMV in / ali PVX.
F.33 Patent v Sloveniji
COBISS.SI-ID: 2483279Razvili smo novo servisno orientirano okolje za rudarjenje podatkov ter referenčno implementacijo Orange4WS (Orange for Web Services). Orange4WS temelji na obstoječem programskem paketu za rudarjenje podatkov Orange ter njegovi komponenti za vizualno programiranje, ki omogoča ročno gradnjo delotokov. Predstavljeno okolje Orange4WS dodaja naslednje razširitve. (1) Uporaba spletnih servisov kot gradnikov delotokov za podatkovno rudarjenje. (2) Uporaba algoritmov za relacijsko rudarjenje podatkov v delotokih. (3) Ontologija področja odkrivanja znanja, ki opisuje komponente delotoka (podatki, znanje ter spletni servisi za podatkovno rudarjenje) na abstrakten način, ki omogoča strojno interpretacijo. Ontologija je uporabljena tudi za avtomatsko gradnjo delotokov s pomočjo planerja. Vse predstavljene razširitve so prikazane na treh realnih primerih uporabe.
F.01 Pridobitev novih praktičnih znanj, informacij in veščin
COBISS.SI-ID: 25004071