Izražanje poliketidnih genskih skupin pogosto regulirajo različne družine regulatornih proteinov. V članku smo izvedli primerjalno bioinformatsko analizo regulatornih genov, ki se nahajajo v oksitetraciklinski genski skupini v Streptomyces rimosus in klortetraciklinski genski skupini v S. aureofaciens. Identificirali smo nov regulatorni gen otcG iz družine LAL(luxR), ki ni prisoten v genski skupini za klortetraciklin. Z eksperimenti prekinitve in povečanim izražanjem otcG gena smo pokazali, da ima pozitivno vlogo pri biosintezi oksitetraciklina.
COBISS.SI-ID: 3608696
V tem članku je bil razvit robusten in široko uporaben reporterski sistem, pripravljen na osnovi gena rppA iz bakterije Saccharopolyspora erythraea. Uporabnost tega reporterskega sistema je bila dokazana z izražanjem gena rppA pod kontrolo različnih heterolognih promotorjev, npr. actII-ORF4/PactI, ermE in njegove močnejše variante ermE*. Preučevan reporterski sistem je pokazal možnost uporabe v različnih laboratorijskih in kompleksnih industrijskih gojiščih, ne glede na kultivacijske pogoje in sestavo gojišča.
COBISS.SI-ID: 3811960
Kvasovka S. cerevisiae v stacionarni fazi rasti je bila okarakterizirana na celični in proteomski ravni. Na celični ravni smo določali optično gostoto, živost celic, vsebnost glikogena, znotrajcelično oksidacijo in celično energijsko metabolno aktivnost, medtem ko so bili na ravni proteoma analizirani proteinski profili z uporabo 2-D elektroforeze. Rezultati, pridobljeni na obeh ravneh, so omogočili boljši vpogled v kviescenco, ki je še vedno slabo pojasnena. Na njihovi osnovi smo določili optimalen čas v stacionarni fazi, ki odraža stabilno metabolno in oksidativno stanje kvasne kulture in je primeren za študij sprememb celičnega oksidativnega statusa in energijske metabolne aktivnosti v odzivu celic na različne okoljske stresorje. Omenjen metodološki pristop na ravni proteoma smo uporabili tudi v našem raziskovalnem projektu v okviru delovnega sklopa WP4 in WP8.
COBISS.SI-ID: 3927928