Raziskava je bila v okviru magistrske naloge s katero je Mario Gorenjak zaključil magistrski program Bioinformatika in si kot prvi v Sloveniji pridobil naziv magister s področja bioinformatike. Do sedaj slovenski visokošolski programi še niso uradno usposabljali kadre za področje bioinformatike. V raziskovalni nalogi smo z uporabo bioinformatskih orodij izvedli podrobno in silico” analizo kandidatnih lokusov na kormosomu 10 povezanih s kronično vnetno črevesno boleznijo (KVČB) v 16 objavljenih asociacijskih študijah v celotnem genomu (GWA) in izvedli asociacijsko analizo za izbrane SNP.
D.10 Pedagoško delo
COBISS.SI-ID: 1630372Prof. Uroš Potočnik je bil mentor tujemu študentu (Karan Karkra), ki je zagovarjal znanstveni magisterij natuji Univerzi (Univerza VIT, Indija). V raziskavi smo iz 21 asociacijskih študij v celotnem genomu (GWA) pri bolnikih s kronično vnetno črevesno boleznijo (KVČB), smo pridobili podatke za 213 polimorfizmov posameznega nukleotida (SNP) povezanih s KVČB. Z uporabo bioinformatskih orodij smo mapirali 213 s KVČB povezanih polimorfizmov na 115 neodvisnih kromosomskih področij (lokusov). Največ KVČB lokusov je bilo na prvem (18), šestem (11) in tretjem (10) kromosomu.
D.10 Pedagoško delo
COBISS.SI-ID: 14386454