Od septembra 2010 do avgusta 2011 je član projektne skupine U. Petrovič gostujoči raziskovalec na 'Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research' (CCBR) Univerze v Torontu, Kanada. Raziskovalci na CCBR so izvedli pionirske raziskave na področju funkcijske genomike in visokozmogljivostne genetike pri kvasovki, U. Petrovič pa je vključen v projekte, kjer se te tehnike še dodatno razvijajo in izboljšujejo.
B.05 Gostujoči profesor na inštitutu/univerzi
Aprila 2011 je Vlada RS sprejela Načrt razvoja raziskovalne infrastrukture za leta 2010 - 2020 (ESFRI). Po tem načrtu je partner tega projekta z Medicinske fakultete UL v letu 2011 postal slovensko nacionalno vozlišče za ESFRI infrastrukturo ELIXIR, D. Rozman pa je bila s strani Vlade RS imenovana za slovensko predstavnico v upravnem odboru (Interim Board, IB) ELIXIR. Projekt ELIXIR predstavlja izgradnjo in vzdrževanje trajne infrastrukture za biološke informacije v Evropi, za podporo raziskavam ved o življenju, njihovega prenosa v medicino in okolje, v bio- industrijo in v družbo nasploh. Zaradi novih tehnologij, kot so nove generacije DNA sekvenciranja, se obseg podatkov podvoji vsakih nekaj mesecev, hitrost pridobivanja podatkov in vrste različni podatkov pa se še povečujejo. Zato je nujno, da se podatki smiselno združujejo. Zbiranje, urejevanje, shranjevanje, arhiviranje in razporejanje biomedicinskih podatkov je ogromen izziv, ki ga ne more rešiti posamezna organizacija niti posamezna država, zato se z ELIXIR vzpostavlja ko-ordinacija na evropski ravni. ELIXIR bo imel osrednji zbirni center, sicer pa bo organiziran razpršeno v številna vozlišča. Ključni akterji slovenskega vozlišča ELIXIR.si so partnerji tega projekta, ki bodo v Sloveniji zadolženi za (a) pridobivanje po-genomskih podatkov različnih izvorov (b) vzpostavljanje in povezovanje bio-računskih centrov, (c) vzpostavljanje in povezovanje infrastrukture za integracijo bioloških podatkov, programske opreme, orodij in servisov ter (d) nudenje servisov za raziskovalno skupnost, vključno s šolanjem in razvojem standardov.
D.03 Članstvo v tujih/mednarodnih odborih/komitejih
V času trajanja projekta smo vsako leto v juniju organizirali znanstveni simpozij Centra za funkcijsko genomiko in bio-čipe (http://cfgbc.mf.uni-lj.si), katerega člani so vse tri ustanove našega projekta. Medicinska fakulteta UL je prevzela glavnino organizacijskih del, medtem ko sta se FRI in IJS s predavanji dogodka aktivno udeležila. Simpozija se letno udeleži 120 raziskovalcev s širšega področja funkcijske genomike, iz Slovenije kot tudi iz tujine in v slovenskem prostoru predstavlja glavni letni dogodek s tega interdisciplinarnega področja.
B.01 Organizator znanstvenega srečanja
V letu 2010 je vodja pričujočega projekta Blaž Zupan prejemnik Zoisovo priznanja za pomembne dosežke v računalništvu.
E.01 Domače nagrade
Razvili smo interaktivno spletno aplikacijo dictyExpress (http://www.biolab.si/dictyexpress), ki omogoča dostop do genskih izraznih profilov izmerjenih v več kot 1.000 različnih eksperimentih s socialno amebo Dictyostelium. Program je korenito spremenil način, kako raziskovalci te amebe dostopajo in analizirajo transkripcijske podatke. dictyExpress je zelo enostaven za uporabo, odločino sprejet s strani raziskovalne skupnosti in v dnevni uporabi raziskovalnih laboratorijev s celega sveta. Grafični uporabniški vmesnik te spletne aplikacije je zaradi interaktivnosti pionirski dosežek na področju bioinformatike. Aplikacijo kot osnovno orodje za pridobitev in analizo transkripcijskih podatkov navaja in vključuje tudi dictybase.org, sicer centralni repozitorij genomskih podatkov te amebe.
F.06 Razvoj novega izdelka
COBISS.SI-ID: 7219028