Spojitvena varianta 2 katepsina E je bila odkrita v celicah želodčnega raka. V raziskavah smo z uporabo poliklonskih protiteles in biotiniliranega inhibitorja pepstatina A prikazali, da se ta varianta encima nahaja v proteinski obliki v celicah HeLa. Fluorescenčna mikroskopija HEK293T celic, v katerih smo izrazili fuzijska proteina katepsin E ali njegovo varianto 2 z zelenim fluorescenčnim proteinom, je pokazala, da sta proteina kolokalizirana. Obe varianti katepsina E s propeptidom in brez njega smo izrazili v E.coli. Proteini so se izrazili v netopni obliki, z uporabljenimi postopki so se pravilno zvili. Ugotovili smo, da je varianta 1 encimsko aktivna, med tem ko je varianta 2 neaktivna. Strukturni model spojitvene variante katepsina E je bil narejen na osnovi določene strukture intermediata katepsin E (koda proteinske banke podatkov PDB 1TZS). Z njegovo pomočjo smo lahko razložili konformacijske lastnosti in izgubo aktivnosti.
COBISS.SI-ID: 25585959
Članek je posvečen odkritju lizosoma (in Nobelovcu Christianu de Duveu) pri čemer je imela pomembno vlogo tudi aspartna proteaza katepsin D. Nadaljni razvoj je vodil do odkritja vrste cisteinskih proteinaz, katepsina E ter drugih proteinaz. Članek predvsem zajema raziskave cisteinskih katepsinov, omenjena pa je tudi vloga aspartnih proteaz, predvsem katepsina D pri razgradnji cistatinov, kar je pomebno pri regulaciji aktivnosti cisteinskih katepsinov.
COBISS.SI-ID: 25347623
Koncept endozomalno/lizosomalnega sistema obsega vrsto bioloških funkcij. Poleg cisteinskih katepsinov sodelujeta pri apoptozi tudi katepsina D in E.
COBISS.SI-ID: 22640935
Kontrola aktivnosti proteoliznih encimov je eden od ključnih fizioloških procesov. Neravnovesje v aktivnosti teh encimov je kritičnega pomena pri številnih patoloških procesih. Nedavne raziskave so pokazale z razvojem modernih novih tehnologij kot je npr. proteomika, da so proteaze tudi signalne molekule. Tako se je koncept delovanja proteaz kot ključnih encimov pri razgradnji beljakovin razširil tudi na proteaze kot signalne molekule. Med mnogimi encimi sodelujejo v teh procesih tudi lisozomalni katepsin D in verjetno katepsin E.
COBISS.SI-ID: 25737767
V tem delu smo podrobno opisali dvojno vlogo lizosomov ter lizosomalnih katepsinov pri dveh glavnih poteh celične smrti in sicer apoptozi ter avtofagiji. Destabilizacija lizosomske membrane s lizosomotropičnimi dražljaji je obetavna strategija ki ne bi samo preprečila avtofagijo, temveč tudi vzpodbudila apoptozo na začetku lizosomalne poti. Po drugi strani, okvarjena avtofagija in lizosomalna razgradnja povezana s povečanim oksidativnim stresom predstavlja osnovo degenerativnim spremembam pri staranju nevronov.
COBISS.SI-ID: 25347879