Receptor TLR15 je značilen za ptice in doslej zanj še ni bil definiran ustrezen ligand. Po funkciji je ekvivalenten družini receptorjev TLR2 pri sesalcih, ki v sistemu naravne imunosti prepoznavajo širok spekter molekularnih vzorcev mikroorganizmov, vključno z bakterijskimi lipoproteini. V naši raziskavi smo preučevali vlogo kokošjega receptorja TLR15 pri odzivu prirojene imunosti na patogeno bakterijo Mycoplasmo synoviae (MS). Ugotovili smo, da okužba/tretiranje makrofagov in hondrocitov z bakterijo MS in specifično njenim N-terminalnim delom, diaciliranim lipopeptidom (MDLP), ki predstavlja amino konec proteina hemaglutinina MSPB, značilno poveča izražanje proteina TLR15 v celicah, ne pa tudi proteinov TLR1 in TLR2, ki skupaj s proteinom TLR15 spadajo v družino kokošjih receptorjev TLR2. Do aktivacije TLR15 pride samo z diacilacilirano ne pa z monoacilirano obliko lipopeptida. Aktivacija TLR15 po stimulaciji z MS, MSPB ali peptidom MDLP sproži povečano izražanje transkripcijskega dejavnika NF-kB ter sproščanje dušikovega oksida (NO). Obenem pa transfekcija ptičjih makrofagov z siRNA zmanjša izražanje TLR15 po stimulaciji celic z MS, kar vodi v zmanjšanje aktivacije imunskega odziva oz. sproščanja NO. Predhodna inkubacija celic protitelesi, specifičnimi za TLR15, zniža nivo sinteze NO, inducirane z MDLP. Povzeto, vsi naši rezultati kažejo na to, da je diaciliran N-terminalni del hemaglutinina MSPB ligand za TLR15 ter da je njuna vezava tisti mehanizem, ki omogoča aktivacijo prirojenega imunskega odziva proti ptičji mikoplazmi Mycoplasma synoviae.
COBISS.SI-ID: 30945497
Gre za raziskavo, kjer smo preučevali vlogo biosinteze holesterola in intermediatov specifično samo v moških spolnih celicah. Uporabljali smo tehnologijo pogojne transgeneze Cre-loxP, s katero smo dosegli izrez gena Cyp51 v spermatogonijih. Gre za prvo tovrstno razvito transgeno žival v Sloveniji. Članek je bil objavljen v reviji Journal of Lipid Research s faktorjem vpliva 4,4, ki je v prvi četrtini revij s področja biokemije in molekularne biologije. V isti reviji smo v letu 2013 objavili tudi pregledni članek iz zgornje teme . KEBER, Rok, ROZMAN, Damjana, HORVAT, Simon. Sterols in spermatogenesis and sperm maturation. Journal of lipid research, 2013, vol. 54, iss. 1, str. 20-33, [COBISS.SI-ID 3134600] in so naš model – sliko izbrali za naslovno stran številke.
COBISS.SI-ID: 30524121
Nadgradili in razširili smo bioinformacijsko orodje microRNA SNiPer, ki je bilo prvotno objavljeno v letu 2012 in omogoča iskanje genetske variabilnosti znotraj mikro RNA genov pri vretenčarjih. V novi verziji (verzija 3) smo vključili nove živalske vrste in izdelali katalog genetske variabilnosti za domače živali. Orodje sedaj omogoča iskanje genetske variabilnosti znotraj mikro RNA za 16 vrst, vključno za 4 vrste domačih živali: prašič, konj, govedo in kokoš. Izdelani katalog bo služil kot osnova za razvijanje novih biooznačevalcev v živinoreji.
COBISS.SI-ID: 3249544
Izdelali smo spletno aplikacijo za iskanje mikro RNA genov, ki se nahajajo znotraj protein-kodirajočih gostiteljskih genov za človeka, miš in kokoš. Z analizo na ravni celotnega genoma smo ugotovili, da se okoli 50% mikro RNA nahaja znotraj gostiteljskih genov. Izdelali smo tudi katalog podatkov, ki omogoča raziskovalcem osnovo za nadaljnje funkcionalne analize intragenskih mikro RNA.
COBISS.SI-ID: 3234696
Haplotip JAK2 46/1 je povezan z razvojem mieloproliferativnih novotvorb in njihova povečana pogostnost je bila tudi zabeležena pri splanhičnih venoznih trombozah (SVT). V tej raziskavi smo proučevali vlogo JAK2 46/1 haplotipa pri nastanku ne-splanhičnih venoznih tromboz (non-SVT). Ugotovili smo statistično značilno povezanost med genotipi rs12342421 GC + CC in rs12343867 TC + CC ter non-SVT. Ugotovili smo tudi, da je haplotip CC na teh dveh polimorfnih mestih povezan s povečanim tveganjem za nastanek bolezni. Stratifikacijska analiza nakazuje, da opazovana povezava med haplotipom JAK2 46/1 in non-SVT ni povezana z drugimi faktorji tveganja za nastanek tromboz. Naši rezultati nakazujejo statistično pomembno povezanost polimorfizmov rs12342421 in rs12343867 s povečanim tveganjem za nastanek non-SVT.
COBISS.SI-ID: 4724799