Oddelek za biotehnologijo in sistemsko biologijo je 8.5.2013 gostil delavno srečanje mednarodnega projekta z naslovom "Metrologija za nadzor infektivnih bolezni, antimikrobne rezistence in škodljivih mikroorganizmov" (INFECT-MET), ki se je začel jeseni 2012. Udeležili so se ga predstavniki vseh sodelujočih inštitutov in klinik iz Velike Britanije (LGC in UCL), Nemčije (BAM in PTB), Turčije (TUBITAK), Belgije (IRMM-JRC) ter Slovenije (NIB in Klinika Golnik). NIB je v projektu eden od vodilnih partnerjev zaradi svojih bogatih izkušenj na področju določanja in kvantifikacije nukleinskih kislin, zato je najobsežnejši delovni paket zaupan vodenju dr. Mojce Milavec. Udeleženci so prestavili napredek svojih raziskav, diskutirali o aktualnih problematikah, na koncu pa začrtali nadaljne skupno delo za uresničitev vizije projekta INFECT-MET. Po srečanju je sledil ogled laboratorijev Oddelka za biotehnologijo in sistemsko biologijo, kjer so se partnerji spoznali z delom oddelka ter njegovo opremljenostjo. V projektu lahko sodelujemo, ker smo s strani Urada za meroslovje imenovani za nosilca nacionalnega etalona za področje Množina snovi v hrani rastlinskega izvora.
D.04 Pobuda za uvedbo novega raziskovalnega področja v Sloveniji
Na osnovi dolgoletnega dela na detekciji GSO v hrani in krmi, za katero smo tudi Nacionalni referenčni laboratorij, smo bili povabljeni, da napišemo šest poglavij za knjigo, ki je izšla pri založbi Blackwell. Svoje delo smo predstavili tudi javnosti s televizijskim prispevkom [COBISS.SI-ID 2675279].
F.13 Razvoj novih proizvodnih metod in instrumentov oz. proizvodnih procesov
V organizaciji Evropske Organizacije za varstvo rastlin (EPPO) in Nacionalnega inštituta za biologijo (NIB) je v Ljubljani od 19.2.-21.2. potekala predstavitev rezultatov evropskega projekta Q-DETECT v obliki delavnice, ki se je je udeležilo 70 udeležencev, raziskovalcev, diagnostikov in inšpektorjev prihaja iz 20 evropskih držav, Kitajske in Peruja. Mednarodna projektna skupina raziskovalcev, med katerimi so bili tudi raziskovalci z Nacionalnega inštituta za biologijo je prikazala uporabo povsem novih metod za določanje povzročiteljev bolezni na terenu. S povečanjem prostega pretoka blaga in povečevanjem količin tovora se je povečala tudi nevarnost širjenja povzročiteljev bolezni rastlin na nova področja. Z namenom razvoja novih, primernejših diagnostičnih metod so se nekateri najboljši evropski raziskovalni laboratoriji in visokotehnološka podjetja združili v evropskem projektu Q-DETECT. Cilj projekta je oblikovati metode, ki bi se jih lahko uporabilo na terenu in bi omogočale občutljivo zaznavanje prisotnosti povzročiteljev bolezni rastlin. Ker pa so povzročitelji bolezni zelo različni – od virusov, bakterij, gliv in do žuželk, smo razvili metode, ki temeljijo na zaznavanju z vonjem, sluhom in vidom. Za natančnejšo določitev organizma pa smo razvili še molekularne metode, ki se jih lahko izvede in odčita na terenu.
D.01 Vodenje/koordiniranje (mednarodnih in domačih) projektov
2.-5. 10.2013 so v Velenju potekali 5. Dnevi zaščite in reševanja na katerih se je predstavil tudi Oddelek za biotehnologijo in sistemsko biologijo. Predstavili smo metode in tehnologije, ki jih uporabljamo za detekcijo patogenih organizmov v vodah, kot so: CIM kromatografska metoda za koncentriranje in detekcijo virusov iz vod, ki jo je možno izvajati na terenu; in novo tehnologijo detekcije patogenov s pomočjo izotermalnega pomnoževanja nukleinskih kislin – LAMP.
F.18 Posredovanje novih znanj neposrednim uporabnikom (seminarji, forumi, konference)
V soorganizaciji Biosistemike d.o.o. in članov tega programa redno potekajo zelo obiskane qPCR delavnice. Od 3. Do 6. 12. 2013 je potekala delavnica z istim naslovom (v sodelovanju z BICOPOLL projektom in European Research Area Network Core Organic 2). Delavnice združujejo odlično znanje s praktičnimi izkušnjami pri dizajniranju, validaciji in uporabi PCR v realnem času v uradni diagnostiki in raziskavah v rastlinski patologiji. Del delavnic so tudi najnovejša spoznanja s področja, kot tudi težave, katerih reševanje je prilagojeno potrebam udeležencev. Zadnje delavnice se je udeležilo veliko raziskovalcev in diagnostikov iz Avstrije, VB, Francije, Poljske, Finske, Latvije, Črne gore in Slovenije.
F.18 Posredovanje novih znanj neposrednim uporabnikom (seminarji, forumi, konference)