V obdobju financiranja programske skupine so člani pridobili 18 ARRS projektov (J4-4250, J4-3631, Z1-0776, L4-5530, L4-2188, V4-0558, J4-9331, V4-1079, V4-1110, L4-5532, Z1-2190, J4-2195, J4-2154, J4-0838, M3-0234, Z7-4248, Z4-1054, J4-4149), 13 evropskih projektov (FP7¬222625 METAEXPLORE, TRIH, FP7-277984, FP7-265877, FP6¬-227220, FP7-613912, 3211-09-000079, FP7¬222654, COST FA0907, FP7-266061, FP-036272, Sc EUUS, FP7-213178) in 3 velike industrijske projekte (Laško, Bia, EKOTIS), poleg številnih manjših industrijskih projektov s katerimi izkazujemo koninuirano zanimanje za znanja programske skupine s strani uporabnikov. Kot vodje projektov se je izkazalo 7 članov programske skupine. Skupina je skozi te projekte pridobila obogatila financiranje ARRS in tako utrdila vpetost programske skupine v raziskovalno mednarodno mrežo. Dosežek izpostavlja pomen naših raziskovalnih rezultatov in izjemnih vodstvenih kompetenc članov programske skupine.
D.01 Vodenje/koordiniranje (mednarodnih in domačih) projektov
COBISS.SI-ID: 4299896V okviru programske skupine je v celotnem obdobju financiranja 2009-2014 doktoriralo 28 kandidatov. Med doktorandi je bilo 14 mladih raziskovalcev, ostali so bili projektno financirani (predvsem iz EU projektov) ali finacirani s strani gospodarstva. Poleg tega je pod mentorstvom članov programske skupine diplomiralo 79 študentov na starem univerzitetnem programu različnih študijskih programov in 30 na prvi bolonjski stopnji. Poleg tega je 21 študentov magistriralo na drugi bolonjski stopnji nazličnih študijskih programov. To je zagotovo izjemen uspeh in pomemben družbeni dosežek programske skupine, ki kaže na konstanten doprinos naših članov k pedagoškemu procesu. Dodatne aktivnosti izven rednega pedagoškega dela predstavja tudi organizacija poletne šole v septembru, 2014 [COBISS.SI-ID 4435576], ko sta prof. Petković in prof. Jamnikova organizirala 3-dnevno mikrobiološko poletno šolo na temo Antibiotiki. Ta je zajemala teoretični in praktični del. V teoretični del so bili vključeni tako predavatelji iz akademske sfere (Biotehniška fakulteta, Fakulteta za farmacijo, Medicinska fakulteta) kot tudi strokovnjaki iz industrije (Krka, Lek, Acies Bio), ki so udeležence seznanili s področjem odkrivanja in razvoja antibiotikov, njihovo industrijsko proizvodnjo in pojavom rezistence mikrobov na antibiotike. V praktičnem delu poletne šole so udeleženci spoznali bioproces produkcije oksitetraciklina z bakterijo Streptomyces rimosus, ki sodi med glavne producente oksitetraciklin.
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 4370040Člani programske skupine smo izvedli v celotnem obdobju financiranja 2009-2014 48 vabljenih predavanj na mednarodnih konferencah in 28 predavanj na tujih univerzah. To kaže na visok mednarodni pomen, odmevnost, aktualnost in zanimivost rezultatov našega raziskovalnega dela. Kaže tudi na to, da so člani programske skupine aktivni in priznani v mednarodni sferi, kar je družbeno pomembno. Še posebej bi izpostavili vabljeno predavanje vodje programske skupine na FEMS-2013 (COBISS 429861), kjer je poročala o dosežkih na področju metagenomike bakterijskih lakaz, vabljeno predavanje na mednarodnem kongresu Power of Microbes in industry and environment 2013 (COBISS 4309112) in na Genetskem kolokviju 2014 (COBISS 4495224), kjer je bila tematika predavanj sociomikrobiologija. V letu 2014 je o tej tematiki predavala tudi na Univerzi v Kopenhagnu (COBISS 4375672) in na Inštitutu Helmholtz v Nemčiji (Munchen) (COBISS 4495480). Tudi ostali člani programske so bili izredno pogosto vabljeni predavatelji: prof. Raspor je v celotnem obdobju financiranja predaval kot vabljen predavatelj 30 krat, prof. Smole-Možina 7 krat in prof. Petković 2 krat. Prof. Raspor je bil leta 2013 plenarni predavatelj na 40. konferenci o kvasovkah v Smolenicah na Slovaškem (COBISS 4086392), kjer je predaval je o pomenu in povezavah med raznolikostjo kvasovk in varnostjo fermentacij.
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 4298616Člani programske skupine smo prijavili v celotnem obdobju financiranja 2 patenta (COBISS 4250744; 3890296); V sodelovanju s Krko d.d. je bil razvit nov in patentno-neodvisen biosintezni proces za proizvodnjo generičnega produkta iz skupine sekundarnih metabolitov za zdravljenje povečane telesne teže za katerega je bila vložen in podeljen patent (EP2019869 B1). Še posebej pa bi izpostavili ameriški patent US 8361777 B2 za izum, ki na podlagi novo odkrite genske skupine za biosintezo nenevadnega tetraciklinskega antibiotika kelokardina omogoča pridobivanje novih biološko aktivnih tetraciklinskih struktur z biosinteznim inženirstvom in polsintezno kemijo. Na ta način pridobljeni novi antibiotiki delujejo na številne patogene organizme v izredno nizkih koncentracijah in kažejo netipičen mehanizem delovanja, kar je ključnega pomena pri razvoju novih zdravil proti bakterijskim infekcijam, ki jih povzročajo patogeni sevi, rezistentni antibiotike, ki so trenutno v klinični praksi. Poleg izjemnega znanstvenega pomena ima nova platforma za razvoj antibiotikov skupaj z v letu 2013 podeljenim patentom potencialno tudi velik aplikativni in komercialni pomen in predstavlja tudi temelj za sodelovanje z akademskimi organizaciji in podjetji, ki se osredotočajo na razvoj novih zdravil. Poleg patentov smo vložili tudi 3 patentne prijave (COBISS 4162936; 3888760; 3746168), ki se nanašajo na optimizacijo proizvodnega procesa s pomočjo genskega inženiringa na področju sekundarnih metabolitov oz. proizvodnje generičnih zdravil; izboljšavo biosinteznega procesa za proizvodnjo generičnega produkta iz skupine sekundarnih metabolitov, za zdravljenje povečane telesne teže (lipstatin) in na razvoj novih zdravilnih učinkovin s pomočjo aciltransferazne domene iz poliketid sintaze za biosintezo FK506. Postopek podpira inkorporacijo nenaravnih podaljševalnih enot na poljubna mesta v poliketidnih strukturah.
F.09 Razvoj novega tehnološkega procesa oz. tehnologije
COBISS.SI-ID: 4250744Člani programske skupine smo v obdobju 2009-2014 organizirali in predsedovali 4 mednarodnim in 7 domačim znanstvenim srečanjem. Vodja programske skupine Prof. Mandić Mulec je predsedovala znanstvenemu in organizacijskemu odboru 12. mednarodnega kongresa BAGECO (Bacterial genetics and Ecology), ki je potekal junija 2013 v Ljubljani in je privabil 300 raziskovalcev iz 50 držav sveta. Kongres je bil izredno uspešen in je domačim raziskovalcem odprl vrata za številne sodelave s svetovno priznanimi raziskovalnimi skupinami.
B.01 Organizator znanstvenega srečanja
COBISS.SI-ID: 4259448