Lentivirusi malih prežvekovalcev (SRLV), ki spadajo v družino Retroviridae, lahko okužijo koze in ovce po vsem svetu. Z analizo dveh filogenetskih genomskih regij, fragmenta gag-pol (1,8 kb) in fragmenta pol (1,2 kb), smo ugotavljali značilnosti sevov SRLV, ki se pojavljajo v Sloveniji. Rezultati naših raziskav so pokazali, da so slovenski sevi SRLV zelo različni. Pri tem pripadajo ovčji sevi genotipu A, kozji sevi pa genotipu A in B. Pri primerjavi virusnih sekvenc smo našli največjo sorodnost pri virusnih sevih, ki spadajo v podtip A5 in smo jih dokazali v dveh tropih ovac (SLO 35, 36). Skupina štirih virusnih sekvenc (SLO 31) se je popolnoma razlikovala od ostalih podtipov skupine A in je ni bilo mogoče uvrstiti v noben podtip. Ena virusna sekvenca iz enega tropa je pripadala samo podtipu B1, v dveh drugih tropih smo določili sekvence, ki so spadale v podtip B1 ( SLO 1 in SLO 37) in genotip A (SLO 2 in 78-88g). Sekvenci dveh kozjih virusnih sevov (SLO 2) smo lahko uvrstili v genotip A, nismo pa mogli določiti podtipa. Sekvenca enega kozjega seva (37 – 88g) iz tropa 37 se je jasno razlikovala od drugih sekvenc virusnih sevov iz tega tropa in je bila bolj sorodna sekvencam genotipa A. Znotraj genotipa A predlagamo nova subtipa A in sicer subtip A14 (SLO 2) in A15 (SLO 31).
COBISS.SI-ID: 512334137
Monenzin in lasalocid sta karboksilna ionoforna antibiotika, ki ju uporabljajo v rejah piščancev kot kokcidiostatika. V okolje prideta z uporabo piščančjih iztrebkov za gnojenje. Ker sta ionoforja, delujeta na prenos kationov preko celičnih membran. Proučevali smo bioakumuilacijo kadmija in svinca pri rakih enakonožcih pri sočasni izpostavitvi monenzinu ali lasalocidu. Pri koncentracijah monenzina, ki so primerljive s tistimi, ki bi jih pričakovali v naravi (1,8 mg/kg hrane), ni bilo učinka na kopičenje kadmija. Pri 100 krat višjih koncentracijah pa je prisotnost lasalocida in monenzina povzročila statistično značilno zmanjšanje vsebnosti kadmija in svinca v testnih organizmih. V naravnih razmerah ne moremo pričakovati tako visokih koncentracij kokcidiostatikov. Sklepamo lahko, da uporaba kontaminiranih iztrebkov na območjih, obremenjenih s težkimi kovinami, ne predstavlja dodatnega tveganja za talne organizme.
COBISS.SI-ID: 3503226
Razvita je bila molekularna metoda za detekcijo povzročitelja paratuberkuloze- bakterije Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map) v blatu goveda, ki združuje nadvse učinkovito izolacijo nukleinskih kislin iz kompleksnejših bakterij, kot je to Map, iz prav tako kompleksnih vzorcev (blato) ter visoko občutljiv, specifičen, kvantitativen PCR v realnem času. Nova metoda, metoda omogoča tudi sicer izredno težavno odkrivanje subklinično bolnih živali.
COBISS.SI-ID: 3525498
Potrdili smo okužbo s golobjim cirkovirusom (PiCV) pri prostoživečih golobih. Gre za vrus s poznanim imunosupresivnim delovanjem. Golobi so bili ulovljeni na več lokacijah na področju mesta Ljubljane. Z uporabo molekularnih metod smo PiCv potrdili pri 74,3%, večina okuženih živali je bila mlajša od enega leta. Molekularna primerjava je pokazala, da sevi so sevi, ki smo jih potrdili pri mestnih golobih, na nukleodidnem in aminokislinske nivoju zelo podobni tistim, ki so bili potrjeni pri okrasnih, tekmovalnih in golobih, ki se vzrejajo za meso.
COBISS.SI-ID: 3564410
V 30-mesečnem obdobju smo pregledali 307 vzorcev jajc in 275 vzorcev jeter na nikarbazin in 365 vzorcev jajc na diklazuril z metodo ELISA, ki smo jo validirali v skladu z Odločbo Evropske Komisije 2002/657/EC. Neskladne vzorce smo potrdili z LC-MS/MS. Povprečna koncentracija diklazurila v jajcih je bila 0.31 µg/kg, kar je pod najvišjimi dovoljeno koncentracijo. Samo v enem vzorcu jajc smo z ELISA testom izmerili 2,26 µg/kg, vendar je potrditev z masno spektrometrijo dala vrednost 1,6 µg/kg. Povprečne vrednosti nikarbazina v jajcih so bile 1,85 µg/kg in v jetrih 21,1 µg/kg. V enem vzorcu jajc in treh vzorcih jeter smo zazneli povišane koncentracije nikarbazina, vendar je bila z LC-MS/MS potrjena koncentracija nad najvišjo dovoljeno (106 µg/kg) le v enem vzorcu jajc.
COBISS.SI-ID: 3588474