S pomočjo NMR spektroskopije v raztopini smo pokazali, da oligonukleotid d(TG4T) v nasprotju s splošno privzetim podatkom ne tvori ene same strukture v obliki tetramernega G-kvadrupleksa s štirimi paralelnimi verigami. Naše meritve so pokazale soobstoj dveh G-kvadrupleksnih struktur. Ena vsebuje T-kvartet poleg štirih G-kvartetov. Zamenjava T z U na 5'-koncu zaporedja d(TG4T) vodi do dimerizacije G-kvadrupleksnih enot. Pokazali smo, da se amonijevi ioni znotraj centralne votline tetramolekularnih G-kvadrupleksov gibljejo cca. 10-krat hitreje kot v dimernih in monomernih G-kvadrupleksih.
COBISS.SI-ID: 4487962
S pomočjo NMR spektroskopije smo določili strukturo 42-nt dimernega siRNA konstrukta, ki je vseboval alternirajoče 2'-F in 2'-OMe modifikacije sladkornega obroča. Prostorska struktura kaže, da konstrukt zavzame strukturo antiparalelne dvojne vijačnice, ki jo sestavlja 19 Watson-Crick baznih parov z dodatnimi 3' UU štrlečimi konci. Stabilnost posameznih baznih parov vzdolž konstrukta ni enakomerna. Imino protoni nekaterih baznih parov se izmenjujejo s topilom, kar kaže na razliko v stabilnosti obeh koncev dvojne vijačnice in je pomembno za pravilno vključitev protismiselne siRNA verige v RISC.
COBISS.SI-ID: 4541466
Določili smo 3D strukture 34-mernega RNK konstrukta s pomočjo NMR spektroskopije v raztopini. Struktura, ki posnema interakcijo let-7 miRNK na prvo komplementarno vezavno mesto, LCS1, kaže dve ne-kanonični regiji: nesimetrično notranjo zanko (preostanki U9-G10 in G23-U24-U25) in izboklino (preostanek A30). V notranji zanki sta preostanka G23 in U25 obrnjena navzven, medtem ko je nukleinska baza U24 obrnjena navznoter. Izbočena nukleinska baza A30 se ne veže znotraj vijačnice, ampak je obrnjena v mali žleb.
COBISS.SI-ID: 4554778
Pripravili smo novo serijo P-stereogenih 1,2-bis[(o-RO-fenil)(fenil) fosfino]etanskih ligandov in jo poimenovali "R-SMS-Phos" serija. Pri tej seriji gre za zamenjavo metilov o-anizilnih skupin DiPAMP liganda z različnimi razvejanimi verigami ogljikovodikov. Novi ligandi so izrazito povečali reakcijsko hitrost in enantioselektivnost pri asimetričnem hidrogeniranju različnih alkenov. Rezultati dobljeni z ligandom "t-Bu-SMS-Phos" so med najboljšimi doslej znanimi dosežki rodij-fosfin kataliziranega hidrogeniranja.
COBISS.SI-ID: 4355098
Pripravili in evaluirali smo serijo R-SMS-Phos ligandov pri Rh(I)-kataliziranem asimetričnem hidrogeniranju seta olefinov. Ciklična struktura R skupin je znatno vplivala na izid reakcije. cPen- in Cy-SMS-Phos liganda sta bila učinkovita, medtem ko sta Ph- in Bn-SMS-Phos kazala počasno kinetiko in nižjo enantioselektivnost tudi v primerjavi s C6F5CH2-SMS-Phos. Rh(I)-(Cy-SMS-Phos) katalizator smo nadalje preizkusili pod milimi pogoji, pri čemer je pokazal odlično enantioselektivnost in visoke TOF. Identificirali smo tudi primere katalize, ki so katalizator- ali substrat-kontrolirane.
COBISS.SI-ID: 4447514