Določili smo strukturo DNK oligonukleotida s tandemskim zaporedjem GGGAGCG, ki se nahaja v regulatorni regiji gena PLEKHG3, ki je povezan z avtizmom. Oligonukleotidno zaporedje se ne zvije v G-kvadrupleks kljub temu, da je bogato z gvaninskimi ostanki. Namesto G-kvartetov je struktura stabilizirana s štirimi G-C baznimi pari v Watson-Crick geometriji, štirimi G∙A baznimi pari v N7-N1 amino karbonil in šestimi G∙G baznimi pari v N1-karbonil simetrični geometriji. G∙A in G-C bazni pari se nahajajo v osrednjem delu strukture. Na vsaki strani strukture sta dve zanki, ki sta povezani s tremi G∙G baznimi pari. Dva adeninska ostanka, ki nista stabilizirana z vodikovimi vezmi, se orientirata proti notranjosti strukture in sta tesno zapakirana s tremi G∙G baznimi pari in dvema G∙A baznima paroma. Ker struktura ni stabilizirana z G-kvarteti, se zvije v končno strukturo že v prisotnosti Li+ ionov. Isto zvitje smo opazili v prisotnosti Na+, K+ in NH4+ ionov.
COBISS.SI-ID: 5625626
Z uporabo NMR, nativne gelske elektroforeze, TDS, CD spektroskopije in DSC kalorimetrije smo okarakterizirali nov intermediat pri zvijanju 1.5 ponovitve telomernega zaporedja Oxytricha nova (Oxy-1.5) G-kvadrupleksa v vodni raztopini. NMR poskusi so pokazali, da intermediat i-Oxy-1.5 obstaja v dveh simetričnih bimolekularnih oblikah, v katerih so vse gvaninske baze vključene v GG N1-karbonil simetrične bazne pare. Kinetična analiza strukturnih prehodov induciranih s kalijevimi ioni je pokazala, da poteka zvijanje Oxy-1.5 G-kvadrupleksa iz i-Oxy-1.5 veliko hitreje in z manj intermediati kot zvijanje iz enojnih verig. Ta študija ponuja dokaze, da se z gvanini bogata zaporedja DNA lahko predorganizirajo v strukture, ki so nagnjene k zvitju v G-kvadrupleks ob interakciji s kationi, kot so kalijevi ioni.
COBISS.SI-ID: 1701423
Z uporabo več-dimenzionalne NMR spektroskopije smo pokazali, da z gvanini bogat DNK oligonukleotid, ki izvira iz N-myc gena, tvori G-kvadruplekse v prisotnosti kalijevih, amonijevih in natrijevih ionov. Enomolekularni G-kvadrupleks, ki se tvori v prisotnosti kalijevih ionov ima tri G-kvartete in tri fleksibilne propelerske zanke. Prostorska struktura s tremi zankami, pri čemer je vsaka zanka sestavljena iz le enega nukleotida, predstavlja manjkajoč strukturni motiv med do sedaj znanimi paralelnimi G-kvadrupleksi. Strukturne lastnosti G-kvadrupleksa in njegova obstojnost tudi pri visokih temperaturah kažejo, da bi tvorba G-kvadrupleksa znotraj prvega introna v N-myc genu lahko imela specifično biološko vlogo. Pri povišanih koncentracijah kalijevih ionov in DNK oligonukleotida se v raztopini spremeni razmerje zvrsti in sicer se zmanjša delež enomolekularnega in poveča delež dvomolekularnega G-kvadrupleksa. V dvomolekularnem G-kvadrupleksu je šest G-kvartetov naloženih eden na drugega, vse verige pa so orientirane v isto smer. Vsaka izmed štirih propelerskih zank je sestavljena iz le enega nukleotida. Posebnost dimernega G-kvadrupleksa je njen osrednji del, kjer sta tretji in četrti G-kvartet povezana z dvema adeninskima preostankoma obrnjenima stran od strukture na način, ki omogoča zaporedno nalaganje šestih G-kvartetov.
COBISS.SI-ID: 4920602
Z metodo »response-surface methodology (RMS) smo raziskovali vpliv deodorizacijskih parametrov (temperatura, pretok pare, čas) na vsebnost fenolov in zmožnost lovljenja radikalov metanolnih ekstraktov. Vsebnost fenolov lahko smatramo kot linearno funkcijo vseh treh parametrov. Opazili pozitivno linearno razmerje med vsebnostjo fenolnih spojin v deodorizoranih oljih in njihovo zmožnostjo lovljenja radikalov. Nizka korelacija med zmožnostjo lovljenja radikalov in celokupno vsebnostjo fenolov in oksidativno stabilnostjo deodoriziranih olj kaže, da se antioksidanti pri lovljenju radikalov odzovejo z različnimi mehanizmi, glede na radikalne vrste in reakcijski medij.
COBISS.SI-ID: 4278136
Predstavili smo učinkovito sintezo in uporabo novega predstavnika ansa-rutenijevih katalizatorjev za asimetrično transfer hidrogeniranje, ki sledi vse bolj popularnemu trendu razvijanja strukturno rigidnih Ru(II) katalizatorjev za redukcijo ketonov. Katalizator se je izkazal kot izredno učinkovit pri redukciji 1-naftil ketonov, kjer so bile dosežene visoke enantioselektivnosti in aktivnosti. Z uporabo 0.1 mol% katalizatorja v HCO2H/Et3N 5:2 zmesi pri 40-60°C smo pripravili alfa-(1-naftil)etanole z do )99,9% enantiomernimi presežki in popolno pretvorbo v 6-20 urah. Ti rezultati so zelo dragoceni pri kovinsko-katalizirani sintezi in uporabni pri pripravi kiralnih farmacevtskih učinkovin ter kiralnih gradnikov.
COBISS.SI-ID: 36628229