SLOTDP-43 je jedrni RNA-vezavni protein, ki tvori inkluzijska telesca pri nevrodegenerativnih boleznih FTLD in ALS. Z metodo iCLIP smo ugotovili, da se TDP-43 in vivo preferenčno veže na dolga UG-bogata zaporedja. Analiza vezave TDP-43 na RNA iz možgan pacijentov s FTLD je pokazala povečano vezavo na nekodirajoči RNA MALAT1 in NEAT1. TDP-43 ima velik pomen pri regulaciji RNA povezovanja v možganih, saj alternativne mRNA izooblike, ki jih regulira TDP-43, kodirajo proteine, ki uravnavajo razvoj živčevja ali pa so povezani z nevrološkimi boleznimi.
COBISS.SI-ID: 8278100
Pokazali smo, da proteinski tvorec por perforin (PFN) lahko povzroči tvorbo invaginacij in celo veziklov v notranjosti orjaških in velikih unilamelarnih lipidnih veziklov. Meritve kapacitivnosti membran so pokazale, da PFN lahko poveča membransko površino, ne da bi tvoril pore v planarnih lipidnih membranah. Tudi v Jurkat celicah je PFN tvoril intracelularne vezikle pred tvorami in sprožil endocitozi-podoben proces.
COBISS.SI-ID: 2493519
Pokazali smo, da se dezmosomski cadherin dezmokolin 2 (Dsc2) veže s holesterolom bogatimi membranskimi lipidnimi rafti, ki vsebujejo kaveolin-1 in flotilin-1 in tudi raftni označevalec ostreolizin. Imunofluorescenčna mikroskopija je potrdili kolokalizacijo Dsc2 in ostreolizina. Delno odstranjevanje holesterola z metil-beta-ciklodekstrinom je zmanjšalo zmožnost tvorbe dezmosomov, delno sprostilo Dsc2 iz raftov in zmanjšalo trdnost medceličnih stikov. Rezultati so pokazali, da je ima Dsc2 afiniteto za rafte, ki se označijo z ostreolizinom, in da je holesterol nujen za sestavo dezmosomov. Zaključimo lahko, da je holesterol potencialni regulator sestavljanja dezmosomov.
COBISS.SI-ID: 27616729