Atx se z visoko afiniteto veže na CaM, kar vodi v njegovo stabilizacijo v redukcijskih pogojih in dvig encimske aktivnosti v kompleksu z CaM, tako v redukcijskih kot tudi v neredukcijskih pogojih. Zgradili smo energetsko najbolj ugoden model kompleksa s katerim smo na strukturni ravni razložili omenjene opažene efekte. Na osnovi tega modela smo predlagali, da strukturno podobne sesalske sPLA2 iz skupin V in X, ne pa IB in IIA, tvorijo stabilni kompleks, kar naj bi tudi vodilo v pospešitev njihove encimske aktivnosti. To smo tudi eksperimentalno potrdili in tako verificirali postavljeni model.
COBISS.SI-ID: 23512103
AtxA in njegova naravna izooblika AtxC is strupa modrasa izražata nevrotoksične in anti-koagulacijske učinke. Določili smo kristalni strukturi obeh toksinov in podali strukturno razlago za razlike v jakostih njunih farmakoloških učinkov.
COBISS.SI-ID: 23047975
Naravni toksin ekvinatoksin II smo uporabili za pripravo fuzijskega proteina z zelenim fluroescenčnim proteinom. Pokazali smo, da ima fuzijski protein ohranjeno sposobnost specifične prepoznave pomembnega celičnega lipida sfingomielina. Ko smo fuzijski protein dodali celicam od zunaj se je specifično vezal na apikalno, ne pa na bazolateralno stran epitelnih celic MDCK. Ko smo fuzijski protein izrazili v celicah se je specifično vezal na Golgijev aparat. Študija odpira vrsto vprašanj o sintezi in distribuciji sfingomielina v celicah.
COBISS.SI-ID: 2119855
Uporabili smo po Fourier-u transformirano infrardečo spektroskopijo (FTIR) in elektronsko paramagnetno resonanco (EPR) za analizo urejenosti in dinamike membranskih lipidov v unilamelarnih liposomih z različno sestavo. Pokazali smo, da so za vezavo citolitičnega proteina ostreolizina pomembne kemijske lastnosti sestavin membrane, njihova specifična distribucija, ter fizikalne lastnosti membranskih nanodomen, ki jih tvorijo steroli v kombinaciji s sfingomielinom (ali drugim visoko urejenim fosfolipidom, dipalmitoilfosfatidilholinom).
COBISS.SI-ID: 2185551
Ugotovili smo pot vnosa TDP-43 v jedro s pomočjo karioferina beta 1. Zmanjšanje izražanja jedrnih transportnih proteinov, ki so v kaskadi karioferina beta 1, povzroči kopičenje TDP-43 v citoplazmi. Pri pregledu izražanja jedrnih transportnih proteinov v tkivih pacientov z FTLD smo ugotovili, da je izražanje proteina CAS (cell apoptosis susceptibility protein) bistveno manjše, kar lahko vpliva na kopičenje TDP-43 v citoplazmi.
COBISS.SI-ID: 23645223