AtxA je nevrotoksična sPLA2 iz strupa modrasa. Molekulo toksina smo označili z nanodelcem zlata in ga injicirali v miško. Po 8 urah smo miško usmrtili in pripravili živčno-mišični preparat mišice soleus za analizo s transmisijskim elektronskim mikroskopom. Rezultati kažejo, da so v presinaptično nevrotoksično delovanje sPLA2 vključene tudi znotrajcelične strukture v živčnem končiču motoričnega nevrona.
COBISS.SI-ID: 22771239
Pokazali smo, da je kalmodulin (CaM) aktivator Atx, sPLA2 iz modrasovega strupa, tako pod neredukcijskimi kot tudi pod redukcijskimi (citosolu-podobnimi) pogoji. Kinetična analiza je razkrila, da CaM vpliva tako na katalitične kot na membranske vezavne lastnosti encima. V citosolu-podobnih pogojih Atx postopoma preide v manj aktivno stanje. CaM konformacijsko stabilizira Atx in mu tako povrne polno encimsko aktivnost. Naši rezultati dopolnjujejo interpretacijo nevrotoksičnosti Atx in predlagajo nov način regulacije sPLA2 v citosolu.
COBISS.SI-ID: 23138087
Cistatinsko naddružino tvorijo inhibitorji cisteinskih proteaz, ki igrajo ključno regulatorno vlogo v procesu razgradnje proteinov. S filogenomsko analizo 2100 prokariontskih in evkariontskih genomov, ter številnih transkriptomov in proteomov, smo raziskali in pojasnili nastanek in evolucijo cistatinske naddružine. Naša študija je spremenila uveljavljen pogled na klasifikacijo, nastanek, funkcionalno diverzifikacijo in evolucijo cistatinske naddružine.
COBISS.SI-ID: 23152679
Na mikroskopiji temelječa fenotipska analiza postaja eno najpomembnejših področij razvoja v funkcijski genomiki. V članku smo opisali mikroskopski presejalni test na živih celicah, s katerim smo v zbirki mutant kvasovke identificirali nenormalno morfologijo oziroma distribucijo fluorescenčno označenih organelov peroksisomov. V raziskavi smo, poleg vseh predhodno znanih genov, identificirali dva nova gena, ki sta potrebna za vnos proteinov v matriks peroksisomov. Opisana raziskava je pionirsko delo, ki kaže na uporabnost visoko natančnega mikroskopskega presejalnega testa na genomski ravni.
COBISS.SI-ID: 22360871
Z računalniškimi simulacijami molekulske dinamike smo opazovali procese v lipidnih dvoslojih iz sfingomielina in holesterola pri njunih različnih molskih razmerjih. Spremembe strukture in dinamike so pokazale nastanek tekoče urejene faze (fizikalnega stanja, v katerem obstajajo lipidni rafti) pri koncentracijah holesterola, višjih od 30 mol%, kar lepo sovpada z aktivnostjo ostreolizina.
COBISS.SI-ID: 4303642