Bakterije se odzivajo na poškodbe DNA z indukcijo usklajenega celičnega odziva, katerega uravnavata proteina RecA in LexA. RecA stimulira cepitev represorja LexA in posledično inducira več kot 40 genov, ki sestavljajo odziv SOS. V objavi predstavljamo strukturo proteina LexA s poudarkom na specifičnih konformacijah, ki omogočijo represijo genov SOS oz. cepitev LexA ob odzivu na poškodbe DNA. Le-te bi lahko bile izhodišče za preprečevanja porajanja bakterijskih patogenov ter raznos determinant rezistence proti antibiotikom.
COBISS.SI-ID: 1889359
Objava opisuje prvo raziskavo virulentnih dejavnikov sevov bakterije Escherichia coli izoliranih iz kože in mehkih tkiv. Pregledanih je bilo 102 sevov izoliranih na Inštitutu za Mikrobiologijo in Imunologijo, MF, Univerze v Ljubljani. Študija je pokazala, da omenjeni sevi izkazujejo virulentni potencial, ki je primerljiv s sevi izolirani iz okužb urinarnega trakta in sepse.
COBISS.SI-ID: 22612775
Optimizirali smo gojišče potrebno za gojenje halofilnih arhej z uporabo metodologije odzivne površine in modeliranja. V optimiziranem gojišču je bila rast hitrejša in končna celična gostota.
COBISS.SI-ID: 25551065
Mnogo genov, ki izkazujejo raznolikost med sevi vpliva na regije, ki so potencialne tarče za bakteriofage. Na podlagi rezultatov pridobljenih z metagenomiko, matematično analizo in računalnškiimi simulacijami predpostavljamo, da bakteriofagi igrajo ključno vlogo pri vzdrževanju raznolikosti populacij prokariontov.
COBISS.SI-ID: 2120015
Raziskana je bila diverziteta prokariontov treh solin v Bengalskem zalivu v Tamil Nadu, Indija. Z verižno reakcijo s polimerazo (PCR) smo dokazali da prevladujejo pripadniki družine Halobacteriaceae. Dokazali smo še pripadnike rodov Haloferax, Halorubrum, Haloarcula, Halobacterium and Halogeometricum. Predstavnike Bacteria, iz rodov smo osamili iz le enega mesta vzorčenja Salinibacter, Cytophaga in Marinococcu medtem ko so prevladujoči predstavniki haloarhejam pripadali rodu Natrinerna.
COBISS.SI-ID: 1959759