Nedavni clanek Johnsona in Goodya (Biochemistry, 2011;50:8264-8269) je prevod 100-let starega clanka Michaelisa in Mentenove. Johnson in Goody sta predstavila zgodovinsko ozadje zacetka analize encimsko kataliziranih reakcij, ki vkljucuje glogalno prilagajanje in evaluacijo inplicitne integrirane vitrostne enacbe. Ponovno sta analizirala podatke, a z numericnim pristopom. V tem clanku je predstavljena prva eksplicitna resitev integrirane Michaeli-Mentenove enacbe. Izpeljano enacbo je mogoce direktno uporabiti racunalniskig programih, ki z nelinerano regresijo prilagajajo koeficienta enacb, in sicer na najosnovnese surove podatke v encimski kinetiki: casovne poteke nastajanja produkta oz. zginevanja reaktanta. Resitev je dosezena s pomocjo Lambertove W funkcije in kaze uporabnost na originalnih podatkih Micaelisa in Mentenove izpred 100 let.
COBISS.SI-ID: 29896921
Polimorfizmi v poti popravljanja napak DNA z izrezovanjem nukleotidov vplivajo na učinkovitost in toksičnost spojin platine pri bolnikih z malignim mezoteliomom.
COBISS.SI-ID: 28755417
17β-hidroksisteroid-dehidrogenaza iz nitaste glive Cochliobolus lunatus (17β-HSDcl)) je trenutno edini opisan encim med glivnimi hidroksisteroid-dehidrogenazami. Natančne strukturne analize kristalnih struktur apo in holo oblike encima, s kumestrolom inhibiranega ternarnega kompleksa in Y167F mutiranega encima so razkrile manjše konformacijske spremembe v vezavni zanki za substrat, ki bi lahko vplivale na encimsko aktivnost 17β-HSDcl. V vseh kristalnih oblikah ima 17β-HSDcl tetramerno zgradbo z 222 simetrijo. Povezave med monomernimi enotami preko Q osi so močnejše kot povezave preko P osi. NADPH se veže v aktivno mesto 17β-HSDcl v iztegnjeni konformaciji. Kumestrol, nesteroidni rastlinski derivat z estrogensko aktivnostjo, zavira delovanje 17β-HSDcl (2,8 µM IC50; 100 µM [4-estren-3,17-dion]) z vezavo v domnevno vezavno mesto steroida. Njegova vezava je poleg številnih vodikovih vezi dodatno stabilizirana s π-π interakcijami s Tyr212. Hitre kinetične analize so jasno pokazale, da je disociacija koencima najpočasnejša stopnja reakcije. To je poleg slabe topnosti steroida razlog, da se ternarni kompleks encim-koencim-steroid ne more kopičiti.
COBISS.SI-ID: 28926169