Vse računske metode, ki jih razvijamo v projektu, so implementirane v našem odprtokodnem sistemu za analizo podatkov Orange. V letu 2008 smo tako Orange razširili z delom za predobdelavo in shranjevanje javno dostopnih podatkov na strežniku. Publikacija, ki jo navajamo, pa primerja Orange in sorodna odprtokodna orodja.
F.06 Razvoj novega izdelka
COBISS.SI-ID: 6280532Povečali smo gostoto kolonij kvasovk na plošči z namenom zmanjšanja potrebne količine preiskovane snovi v presejalnem testu na genomski ravni. Nadgradili smo robotski manipulator tako, da dosega gostoto 1536 kolonij/ploščo (prej 384). Trenutno so v uporabi metode, ki temeljijo na meritvah površine kolonije, pri čemer niso upoštevane razlike v oblikah kolonij v prostoru. Da bi se izognili tej napaki, smo razvili pristop kjer z uporabo presevnega optičnega čitanja plošč s kolonijami, v kombinaciji z lastnim, v ta namen razvitim algoritmom, pridobimo tridimenzionalno obliko posamezne kolonije.
F.10 Izboljšanje obstoječega tehnološkega procesa oz. tehnologije
COBISS.SI-ID: 2073200