Analiza relativne genske ekspresije z uporabo qPCR je pokazala da je način izražanja transkriptov konsistenten med štirimi vrstami fižola. Rezultati kažejo na da so ti transkripti v splošni odziv na sušni stres. Obetajoče rezultate smo dobili v preliminarni študiji z uporabo mikročip tehnologije, kjer smo uporabili sojin GeneChip Array (Affymetrix). Skoraj 15% od 3500 setov prob je pokazalo na transkripte, ki so vključeni v odziv na sušni stres.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 2845544Pri rastlinah obstaja široka paleta proteolitskih encimov. Objave kažejo, da cisteinske protease pogosto vplivajo na odziv na sušni stres, malo objav pa kaze na vpliv serinskih proteaz. Naši rezultati kažejo na številne vloge serinskih proteaz pri odzivu na sušni stres.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 21158439Identifikacija genov katerih izražanje je spremenjeno v primeru suše je pomemben prvi korak pri razumevanju procesa odpornosti na sušo pri navadnem fižolu. Spremembe v izražanju genov v listih pri različnih stopnjah sušnega stresa smo identificirali z DDRT PCR in potrdili z kvantitativnim PCR v realnem času. Odziv 15 transkriptov je bil signifikantno spremenjen (p<0.05) pri vseh sortah in obeh režimih suše. 8 transkriptov je imelo povečan odziv, 7 pa zmanjšan. Za pet identificiranih genov smo prvič pokazali, da vplivajo na odziv na sušni stres.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 2474344Pri rastlinah obstaja široka paleta proteolitskih encimov. Njihova raven je odvisna od pretvorbe proteinov, osnovne komponente pri razvoju rastlin in adaptacije okoljskim razmeram. Objave kažejo, da cisteinske protease pogosto vplivajo na odziv na sušni stres, malo objav pa kaze na vpliv serinskih proteaz. Naši rezultati kažejo na številne vloge serinskih proteaz pri odzivu na sušni stres, od povečanega pretvorbe proteinov do zmanjšane proteolize na specifičnih mestih.
B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci
COBISS.SI-ID: 2702696Razvili smo postopek cimografije s fluorescentnimi substrati, ki nam je odkril heterogenost serinskih proteaz in nam omogočil detektirati kvantitativne relativne proteolitske aktivnosti v listih fižola. Nivoji nekaterih serinskih proteaz so se razlikovali na različne načine v sušnem stresu. Izolirali smo serinsko proteazo (BSP) in phenylalanyl aminopeptidazo (FAP) vključeno v odziv fižola na sušo ter klonirali bsp in fap gene. Poleg tega pa smo analizirali gensko ekspresijo BSP in FAP v listih pri rastlinah izpostavljenih suši.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 3110760