V tem delu je bila preučena vloga dveh regulatornih genov rapG in rapH v biosintezi medicinsko in industrijsko pomembnega naravnega produkta rapamicina, ki ga proizvaja Streptomyces hygroscopicus. S prekomernim izražanjem se je bistveno povečal donos, dočim je delecija teh dveh genov rezultirala v popolni prekinitvi biosinteze rapamicina. V tem članku so razloženi osnovni mehanizmi regulacije biosinteze rapamicina, potrjena vpletenost genov rapG in rapH, spoznanja pa so neposredno uporabna za industrijske cilje za povečanje donosa rapamicina.
COBISS.SI-ID: 3310200
Preučevali smo specifičnost epotilonskih aciltransferaz (AT), ki odločajo o izbiri podaljševalnih enot v času biosinteze poliketidnih spojin in na takšen način bistveno vplivajo na končno strukturo te medicinsko pomembne protirakaste učinkovine. Pokazali smo tudi, da se lahko s pomočjo ciljno specifične (site-directed) mutageneze vpliva na specifičnost AT domen. V tem eksperimentu smo uporabili AT domene iz FKBP12 imunofilinskih ligandov, kot so FK506 in rapamicina. Znanja pridobljena v epotilonskem sistemu nas usmerjajo v pristopih manipulacije PKS sistema, kot je to npr. FK506.
COBISS.SI-ID: 3401080
Izražanje bakterijskih poliketidnih genskih skupin je pogosto regulirano s številnimi različnimi družinami regulatornih proteinov, kot je to primer pri tudi FK506. V tem članku smo izvedli primerjalno bioinformatsko analizo regulatornih genov, ki se nahajajo v oksitetraciklinski genski skupini v Streptomyces rimosus in klortetraciklinski genski skupini v S. aureofaciens, identificirali smo nov regulatorni gen otcG iz družine LAL(luxR), in ga z eksperimenti prekinitve in povečanim izražanjem otcG gena ovrednotili kot pogojno pozitivni regulator.
COBISS.SI-ID: 3608696
V sklopu tega prispevka smo prikazali rezultate raziskav na regulatornih genih, ki se nahajajo v genskih skupinah za biosintezo treh tetraciklinskih antibiotikov. Identificirali smo regulatorne gene, ki uravnavajo biosintezo dveh industrijsko pomembnih tetraciklinov, klortetraciklina in oksitetraciklina in novega tetraciklina kelokardina. S pomočjo novejših metod metabolnega inženirstva so bili nekateri sevi gensko manipulirani in tako pridobljeni rezultati so nam omogočili bolj poglobljeno razumevanje delovanja teh regulatornih elementov in njihovega vpliva na končni donos.
COBISS.SI-ID: 3580280
V tem članku smo identifikacirali prej nepoznano regije genske skupine FK506 iz bakterije S. tsukubaensis NRRL 18488, ki vsebuje gene za zagotavljanje nenavadnih gradnikov za biosintezo FK506. Med drugim smo opredelili skupine genov, ki kodirajo biosintezo podaljševalne enote, ki določa alilno skupino na C21 spojine FK506, ki je sekundarni metabolit z močnimi imunosupresivno aktivnostjo in je trenutno registriran za uporabo kot imunsupresant pri presaditvi organov. Zanimivo je, da smo opredelili majhen neodvisen sistem diketid-sintaze, ki je vpletena biosintezo alilne skupine.
COBISS.SI-ID: 3754104