Predstavitev pristopa analize na genomski ravni z uporabo kvasovke Saccharomyces cerevisiae kot modelnega organizma za določitev vplivov različnih kemičnih perturbacij na evkariontske celice.
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 20635431Za raziskovalno skupnost modelnega organizma D. discoideum smo razvili spletni vmesnik za analizo in dostop do obsežnih podatkov o ekspresiji in funkciji genov (www.ailab.si/dictyExpress) [F.06]. Predstavlja novost glede načina dostopa do podatkov, saj poleg prikaza podatkov omogoča enostavno, interaktivno analizo izbranih genov. Dnevno ga uporablja ~15% raziskovalcev tega organizma po svetu. Vmesnik je vključen v referenčno bazo modelnega organizma (www.dictyBase.org) [F.16], ki beleži 60000 zadetkov mesečno.
F.06 Razvoj novega izdelka
COBISS.SI-ID: 7219028Od septembra 2008 do junija 2009 je Blaž Zupan kot gostujoči profesor in raziskovalec deloval na Centru za tkivno inženirstvo na Univerzi v Pavii v Italiji. Tekom gostovanja je tam vzpostavil in organiziral skupino za bioinformatiko, katere cilj je razvoj informaticˇnih orodij za sˇtudij razvoja tkiv in zarodnih celic. V sodelovanju s prof. Riccardom Bellazzijem je tekom gostovanja izvedel vrsto tecˇajev s podrocˇja odkrivanja znanj in bioinformatike.
B.05 Gostujoči profesor na inštitutu/univerzi
COBISS.SI-ID: 7218516V oktobru in novembru 2009 je član projektne skupine dr. Uroš Petrovič obiskal laboratorij prof. Igorja Štagljarja, utemeljitelja tehnike membranskega dvohibridnega sistema kvasovke, na Univerzi v Torontu v Kanadi. Namen obiska je bil seznanitev s tehniko ter z njeno uporabo identifikacija proteinskih interaktorjev Izh2 proteina, homologa adiponektinskega receptorja kvasovke. Identificiranih je bilo deset potencialnih interaktorjev Izh2.
B.05 Gostujoči profesor na inštitutu/univerzi
COBISS.SI-ID: 2073200Na projektu sta sodelovala poleg ostalih sodelovala tudi dva mlada raziskovalca, ki sta v okvriu projektnih vsebin pripravila in zagovorila svoj doktorat. To sta Tomaž Curk in Minca Mramor (menor: Blaž Zupan). Oba sta bila dejavna tudi pri prenosu pridobljenih znanj v prakso, ter pri publiranju svojih rezutatov v mednarodnih revijah.
D.09 Mentorstvo doktorandom
COBISS.SI-ID: 250775808