V prestižni biokemijski reviji Trends in Biochemical Sciences smo opisali strukturne vzorce in način delovanja proteinov, ki tvorijo pore. Listeriolizin je od holesterola odvisen citolizin, za katere se je izkazalo, da imajo strukturo podobno nekaterim pomembnim proteinom imunskega sistema, npr. proteinom komplementa ali perforinu. Razumevanje delovanja LLO bo tako prispevalo tudi k razumevanju delovanja teh proteinov.
COBISS.SI-ID: 1893967
Opisali smo preliminarne študije vezave LLO na lipidne membrane in preverili kateri faktorji omogočajo stabilno vezavo. Uporabili smo različne eksperimentalne pristope, metodo površinske plazmonske resonance, vgradnjo v lipidne monosloje, izhajanje fluorescenčnih markerjev iz lipidnih veziklov, itn. Pokazali smo, da je za stabilno vezavo v membrane potrebna pražna vrednost holesterola in da se LLO na membrane veže tudi pri suboptimalnem fiziološkem pH.
COBISS.SI-ID: 22569689
Metodo površinske plazmonske resonance smo uporabili za spremljanje kinetike ekstrakcije holesterola iz membran s pomočjo molekule ciklodekstrina. V članku smo razvili metodološki pristop in uporabili vezavo CDC streptolizina O kot dokaz, da je membrana po delovanju ciklodekstrina brez holesterola.
COBISS.SI-ID: 1826895
Holesterol ima pomembno strukturno vlogo v lipidnih membranah. V tem poglavju opišemo, kako lahko spremljamo ekstrakcijo holesterola iz lipidnih membran z različnimi biofizikalnimi pristopi. Še posebej opišemo pristop površinske plazmonske resonance, ki smo ga razvili tekom tega projekta.
V tem poglavju opišemo uporabo površinske plazmonske resonance v bazičnih znanostih in analitskih pristopih. Podamo kratke teoretične osnove, na kakšen način potekajo meritve in kako se metodo uporablja za spremljanje makromolekulskih interakcij.
COBISS.SI-ID: 23308761