V tem članku smo opisali razvoj nove metode za detekcijo aktivnosti HtrA proteaze iz H. pylori, ki temelji na uporabi peptidnega substrata na osnovi fluorescenčnega resonančnega prenosa energije (FRET). Peptid smo razvili na osnovi proteomskega pristopa razvitega v našem laboratoriju (direktno profiliranje proteazne specifičnosti v gelu). Ker so serinske proteaze pogosto občutljive tudi na kovinske ione, smo proučili vpliv divalentnih ionov na aktivnost HtrA. Ugotovili smo, da so Zn++ in Cu++ ioni inhibitorji proteazne aktivnosti, kar smo testirali s pomočjo in vitro poskusov s cepitvijo kazeina, E-kaderina in novega FRET testa. Potencialna vezavna mesta za ione smo nadalje analizirali s pomočjo testa termičnega premika in termoforeze. Ta spoznanja bodo nedvomno pomembno doprinesla k razvoju novih proteaznih inhibitorjev na osnovi kovinskih ionov, ki bi pomagali v boju proti bakterijskim okužbam.
COBISS.SI-ID: 30406147