Med razvojem RDČD lahko nastane spekter lezij z različnim malignim potencialom in dvoumnimi morfološkimi značilnostmi. Z namenom identifikcje novih biomarkerjev smo predhodno izvedli bioinformatsko analizo, s katero smo odkrili različno izražene gene med adenomom DČD in RDČD. Z obstoječo raziskavo smo potrdili diagnostični in prognostični pomen 6 komponent zunajceličnega matriksa (ECM), ki smo jih identificirali s prejšnjo bioinformatsko analizo (DCN, EPHA4, FN1, SPARC, SPON2 in SPP1). Vključili smo 40 bolnikov in 60 vzorcev tkiva, ki so bili fiksirani v formalinu in vklopljeni v parafin (adenomi, malignizirani adenomi, RDČD z in brez zasevanja v področne bezgavke). Rezultati qPCR so pokazali različno izražanje med skupinami za vse gene, razen za EPHA4. Njihovo izražanje se je sorazmerno povečalo s stopnjo malignosti. Med njimi so bili SPARC, SPON2 in SPP1 različno izraženi med adenomi in maligniziranimi adenomi. Imunohistokemijska analiza je pokazala, da se je intenzivnost obarvanja povečala z napredovanjem lezij. Sedanji rezultati kažejo, da imajo lahko proteini, povezani z ECM, pomembno vlogo pri razvoju RDČD, z možno diagnostično uporabo za razlikovanje med različnimi lezijami, na primer med adenomi in maligniziranimi adenomi. Vendar pa je bila le za DCN ugotovljena pomembna razlika za napoved zasevanja RDČD v področne bezgavke.
COBISS.SI-ID: 34452185
Mikro RNA iz družine miR-200 so eksperimentalno dokazani regulatorji EMP. Čeprav je EMP široko uveljavljen mehanizem razvoja in napredovanja RDČD, še vedno obstajajo omejeni in sporni podatki o izražanju družine miR-200 in njihovih ciljnih genov med razvojem in napredovanjem RDČD. V našo raziskavo smo vključili v formalinu fiksirane in v parafin vklopljene vzorce biopsij 40 bolnikov (10 z adenomom in 30 primerov RDČD s pripadajočo normalno sluznico). Izražanje miR-141, miR-200a/b/c in miR-429 ter njihovih ciljnih genov (CDKN1B, ONECUT2, PTPN13, RND3, SOX2, TGFB2 in ZEB2) smo analizirali z uporabo qPCR v realnem času. Izražanje E-kadherina smo analizirali z uporabo imunohistokemije. Vse miRNA so pokazale znižano izražanje in njihovi ciljni geni so pokazali nasprotno izraženost v RDČD v primerjavi z adenomom. Opazili smo spremenjeno izražanje družine miR-200 na invazivnem delu v primerjavi s centralnim delom tumorja ter korelacija izražanja z miR-200b, CDKN1B, ONECUT2 in ZEB2 pri RDČD z zasevki v področnih bezgavkah. Izražanje družine miR-200 in SOX2 je tudi povezano z izražanjem E-kadherina. Ti rezultati kažejo, da družina miR-200 in njihovi ciljni geni prispevajo k napredovanju adenoma v RDČD, invazivnih lastnostih in razvoju metastaz. Naši rezultati močno podpirajo postavljene hipoteze o delnem EMP in intra-tumorski heterogenosti med razvojem in napredovanjem RDČD.
COBISS.SI-ID: 34547929
RDČD je ena najpogostejših oblik raka na svetu. Molekularne poti, ki sodelujejo pri razvoju RDČD, vključujejo postopno kopičenje mutacij, epigenetske spremembe in spremembe v izražanju genov, kar vodi do nenadzorovane delitve celic in invazivnega fenotipa. Vendar v vseh primerih RDČD ne najdemo opisanih sprememb, kar kaže na to, da obstajajo neodkriti mehanizmi razvoja RDČD. Zato smo raziskali SULF1, ki je bil prej identificiran z uporabo bioinformatske analize kot kandidat za razvoj RDČD. Vključili smo 65 vzorcev biopsij bolnikov z adenom, maligniziranimi adenomom in RDČD z in brez zasevkov v področne bezgavke. Preučili smo izražanje SULF1 z uporabo qPCR. Izražanje SULF1 se je postopoma povečevalo od adenoma, kjer je bilo izražanje znižano, do invazivnega RDČD, kjer je bilo izražanje zvišano. Naše ugotovitve nakazujejo, da je SULF1 vključen v razvoj in napredovanje RDČD.
COBISS.SI-ID: 34521561