Inflamasom je znotrajcelični multiproteinski kompleks, ki ga sestavljajo Nodu-podoben receptor (NLR), adapterski protein in kaspaza-1. Izmed receptorjev iz družine NLR je največ znanega o NLRP3. NLRP3 aktivira veliko različnih stimulusov, kot so mikrobni toksini in ATP in ostali endogeni signali npr. kristali natrijevega urata, ki se odlagajo pri putiki. Trenutno raziskujemo mehanizem sestavljanja inflamasoma. Z namenom opredelitve domen NLRP3, ki sodelujejo pri zaznavanju aktivatorjev in pri oligomerizaciji smo pripravili 21 skrajšanih variant NLRP3 in jih izrazili v makrofagih, ki ne vsebujejo endogenega NLRP3. Pokazali smo, da so variante, ki ne vsebujejo C-končne LRR domene, polno odzivne na različne aktivatorje NLRP3 inflamasoma. Precej natančno smo določili skrajšan predel NLRP3, ki je še polno funkcionalen in ustreza nekaterim naravno prisotnim alternativnim variantam. Za krajše oblike smo pokazali, da ne podpirajo sestavljanja inflamasoma, vendar pa se še odzivajo na dodatek aktivatorjev. Testirali smo nekaj možnih mehanizmov aktivacije NLRP3 inflamasoma, tudi mehanizem, pri katerem oligomerizacijo sproži ena aktivirana molekula NLRP3, kot v primeru homolognega proteina NLRC4, vendar naši rezultati nakazujejo, da aktivacija NLRP3 ne poteka na enak način. To študijo smo objavili v Hafner-Bratkovič* in sod., Nature Communications, 2018. Rezultate smo predstavili v obliki posterjev, izbranih kratkih predstavitev in predavanj na mednarodnih konferencah in srečanjih. Študija je bila izbrana tudi za predstavitev na dogodku ARRS: Odlični v znanosti 2019.
B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci
COBISS.SI-ID: 6730778Raziskujemo tudi načine inhibicije inflamasoma NLRP3. Na podlagi razpoložljivih struktur proteinov, ki sestavljajo inflamasom in modelov NLRP3 smo načrtovali dve skupini potencialnih inhibitornih peptidov. Pokazali smo, da peptidi inhibirajo aktivacijo kaspaze-1 in sproščanje IL-1ß in IL-18 iz mieloidnih celic v odvisnosti od koncentracije. Poleg tega smo pokazali, da peptid iz ASC specifično zavira aktivacijo inflamasoma NLRP3 in ne vpliva na druge inflamasome ter inhibira peritonitis v mišjem modelu. Rokopis Sušjan in sod. & Hafner-Bratkovič* je pred oddajo druge revizije v revijo FASEB J, doktorska študentka Petra Sušjan pa je v 2020 prejela štipendijo L’Oreal.
B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci
COBISS.SI-ID: 6669594